Protein–RNA interactions for Protein: E0CZ16

Klhl3, Kelch-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 587 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl3E0CZ16 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Klhl3E0CZ16 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Klhl3E0CZ16 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Klhl3E0CZ16 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Klhl3E0CZ16 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Klhl3E0CZ16 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Klhl3E0CZ16 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Klhl3E0CZ16 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Klhl3E0CZ16 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Klhl3E0CZ16 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Klhl3E0CZ16 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Klhl3E0CZ16 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Klhl3E0CZ16 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Klhl3E0CZ16 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Klhl3E0CZ16 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Klhl3E0CZ16 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Klhl3E0CZ16 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Klhl3E0CZ16 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Klhl3E0CZ16 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Klhl3E0CZ16 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Klhl3E0CZ16 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Klhl3E0CZ16 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Klhl3E0CZ16 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Klhl3E0CZ16 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Klhl3E0CZ16 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Klhl3E0CZ16 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Klhl3E0CZ16 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Klhl3E0CZ16 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Klhl3E0CZ16 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Klhl3E0CZ16 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Klhl3E0CZ16 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Klhl3E0CZ16 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Klhl3E0CZ16 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Klhl3E0CZ16 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Klhl3E0CZ16 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Klhl3E0CZ16 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Klhl3E0CZ16 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Klhl3E0CZ16 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Klhl3E0CZ16 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Klhl3E0CZ16 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Klhl3E0CZ16 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Klhl3E0CZ16 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Klhl3E0CZ16 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Klhl3E0CZ16 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Klhl3E0CZ16 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Klhl3E0CZ16 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Klhl3E0CZ16 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Klhl3E0CZ16 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Klhl3E0CZ16 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Klhl3E0CZ16 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Klhl3E0CZ16 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Klhl3E0CZ16 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Klhl3E0CZ16 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Klhl3E0CZ16 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Klhl3E0CZ16 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Klhl3E0CZ16 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Klhl3E0CZ16 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Klhl3E0CZ16 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Klhl3E0CZ16 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Klhl3E0CZ16 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Klhl3E0CZ16 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Klhl3E0CZ16 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Klhl3E0CZ16 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Klhl3E0CZ16 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Klhl3E0CZ16 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Klhl3E0CZ16 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Klhl3E0CZ16 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Klhl3E0CZ16 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Klhl3E0CZ16 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Klhl3E0CZ16 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Klhl3E0CZ16 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Klhl3E0CZ16 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Klhl3E0CZ16 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Klhl3E0CZ16 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Klhl3E0CZ16 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Klhl3E0CZ16 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Klhl3E0CZ16 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Klhl3E0CZ16 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Klhl3E0CZ16 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Klhl3E0CZ16 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Klhl3E0CZ16 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Klhl3E0CZ16 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Klhl3E0CZ16 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Klhl3E0CZ16 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Klhl3E0CZ16 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Klhl3E0CZ16 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Klhl3E0CZ16 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Klhl3E0CZ16 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Klhl3E0CZ16 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Klhl3E0CZ16 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Klhl3E0CZ16 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Klhl3E0CZ16 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Klhl3E0CZ16 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Klhl3E0CZ16 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Klhl3E0CZ16 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Klhl3E0CZ16 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Klhl3E0CZ16 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Klhl3E0CZ16 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Klhl3E0CZ16 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Klhl3E0CZ16 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms