Protein–RNA interactions for Protein: D3Z6J4

Vpreb3, Pre-B lymphocyte gene 3, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb3D3Z6J4 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Vpreb3D3Z6J4 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Vpreb3D3Z6J4 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Vpreb3D3Z6J4 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Vpreb3D3Z6J4 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Vpreb3D3Z6J4 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Vpreb3D3Z6J4 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Vpreb3D3Z6J4 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Vpreb3D3Z6J4 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Vpreb3D3Z6J4 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Vpreb3D3Z6J4 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Vpreb3D3Z6J4 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Vpreb3D3Z6J4 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Vpreb3D3Z6J4 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Vpreb3D3Z6J4 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Vpreb3D3Z6J4 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Vpreb3D3Z6J4 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Vpreb3D3Z6J4 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Vpreb3D3Z6J4 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Vpreb3D3Z6J4 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Vpreb3D3Z6J4 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Vpreb3D3Z6J4 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Vpreb3D3Z6J4 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Vpreb3D3Z6J4 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Vpreb3D3Z6J4 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Vpreb3D3Z6J4 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Vpreb3D3Z6J4 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Vpreb3D3Z6J4 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Vpreb3D3Z6J4 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Vpreb3D3Z6J4 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Vpreb3D3Z6J4 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Vpreb3D3Z6J4 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Vpreb3D3Z6J4 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Vpreb3D3Z6J4 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Vpreb3D3Z6J4 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Vpreb3D3Z6J4 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Vpreb3D3Z6J4 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Vpreb3D3Z6J4 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Vpreb3D3Z6J4 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Vpreb3D3Z6J4 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Vpreb3D3Z6J4 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Vpreb3D3Z6J4 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Vpreb3D3Z6J4 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Vpreb3D3Z6J4 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Vpreb3D3Z6J4 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Vpreb3D3Z6J4 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Vpreb3D3Z6J4 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Vpreb3D3Z6J4 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Vpreb3D3Z6J4 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Vpreb3D3Z6J4 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Vpreb3D3Z6J4 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Vpreb3D3Z6J4 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Vpreb3D3Z6J4 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Vpreb3D3Z6J4 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Vpreb3D3Z6J4 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Vpreb3D3Z6J4 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Vpreb3D3Z6J4 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Vpreb3D3Z6J4 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Vpreb3D3Z6J4 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Vpreb3D3Z6J4 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Vpreb3D3Z6J4 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Vpreb3D3Z6J4 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Vpreb3D3Z6J4 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Vpreb3D3Z6J4 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Vpreb3D3Z6J4 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Vpreb3D3Z6J4 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Vpreb3D3Z6J4 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Vpreb3D3Z6J4 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Vpreb3D3Z6J4 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Vpreb3D3Z6J4 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Vpreb3D3Z6J4 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Vpreb3D3Z6J4 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Vpreb3D3Z6J4 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Vpreb3D3Z6J4 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Vpreb3D3Z6J4 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Vpreb3D3Z6J4 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Vpreb3D3Z6J4 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Vpreb3D3Z6J4 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Vpreb3D3Z6J4 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Vpreb3D3Z6J4 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Vpreb3D3Z6J4 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Vpreb3D3Z6J4 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Vpreb3D3Z6J4 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Vpreb3D3Z6J4 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Vpreb3D3Z6J4 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Vpreb3D3Z6J4 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Vpreb3D3Z6J4 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Vpreb3D3Z6J4 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Vpreb3D3Z6J4 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Vpreb3D3Z6J4 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Vpreb3D3Z6J4 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Vpreb3D3Z6J4 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Vpreb3D3Z6J4 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Vpreb3D3Z6J4 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Vpreb3D3Z6J4 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Vpreb3D3Z6J4 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Vpreb3D3Z6J4 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Vpreb3D3Z6J4 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Vpreb3D3Z6J4 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Vpreb3D3Z6J4 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms