Protein–RNA interactions for Protein: D3Z4U6

Gm5934, Predicted gene 5934, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5934D3Z4U6 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm5934D3Z4U6 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm5934D3Z4U6 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm5934D3Z4U6 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm5934D3Z4U6 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm5934D3Z4U6 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm5934D3Z4U6 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm5934D3Z4U6 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm5934D3Z4U6 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm5934D3Z4U6 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm5934D3Z4U6 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm5934D3Z4U6 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm5934D3Z4U6 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm5934D3Z4U6 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm5934D3Z4U6 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm5934D3Z4U6 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm5934D3Z4U6 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm5934D3Z4U6 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm5934D3Z4U6 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm5934D3Z4U6 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm5934D3Z4U6 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm5934D3Z4U6 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm5934D3Z4U6 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm5934D3Z4U6 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm5934D3Z4U6 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm5934D3Z4U6 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm5934D3Z4U6 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gm5934D3Z4U6 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gm5934D3Z4U6 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Gm5934D3Z4U6 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gm5934D3Z4U6 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gm5934D3Z4U6 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gm5934D3Z4U6 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gm5934D3Z4U6 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gm5934D3Z4U6 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gm5934D3Z4U6 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gm5934D3Z4U6 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gm5934D3Z4U6 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gm5934D3Z4U6 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Gm5934D3Z4U6 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm5934D3Z4U6 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm5934D3Z4U6 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm5934D3Z4U6 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm5934D3Z4U6 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm5934D3Z4U6 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm5934D3Z4U6 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm5934D3Z4U6 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm5934D3Z4U6 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm5934D3Z4U6 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm5934D3Z4U6 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm5934D3Z4U6 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm5934D3Z4U6 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm5934D3Z4U6 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm5934D3Z4U6 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm5934D3Z4U6 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm5934D3Z4U6 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm5934D3Z4U6 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm5934D3Z4U6 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm5934D3Z4U6 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm5934D3Z4U6 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm5934D3Z4U6 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm5934D3Z4U6 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm5934D3Z4U6 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm5934D3Z4U6 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm5934D3Z4U6 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm5934D3Z4U6 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm5934D3Z4U6 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm5934D3Z4U6 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm5934D3Z4U6 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm5934D3Z4U6 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm5934D3Z4U6 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm5934D3Z4U6 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm5934D3Z4U6 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm5934D3Z4U6 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm5934D3Z4U6 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm5934D3Z4U6 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm5934D3Z4U6 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm5934D3Z4U6 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm5934D3Z4U6 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm5934D3Z4U6 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm5934D3Z4U6 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm5934D3Z4U6 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm5934D3Z4U6 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm5934D3Z4U6 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm5934D3Z4U6 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm5934D3Z4U6 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm5934D3Z4U6 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm5934D3Z4U6 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm5934D3Z4U6 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm5934D3Z4U6 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm5934D3Z4U6 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm5934D3Z4U6 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm5934D3Z4U6 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm5934D3Z4U6 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm5934D3Z4U6 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm5934D3Z4U6 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm5934D3Z4U6 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm5934D3Z4U6 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm5934D3Z4U6 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm5934D3Z4U6 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms