Protein–RNA interactions for Protein: D3YXS5

Kif28p, Kinesin-like protein KIF28P, mousemouse

Predictions only

Length 1,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kif28pD3YXS5 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Kif28pD3YXS5 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Kif28pD3YXS5 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Kif28pD3YXS5 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Kif28pD3YXS5 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Kif28pD3YXS5 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Kif28pD3YXS5 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Kif28pD3YXS5 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Kif28pD3YXS5 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Kif28pD3YXS5 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Kif28pD3YXS5 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Kif28pD3YXS5 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Kif28pD3YXS5 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Kif28pD3YXS5 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Kif28pD3YXS5 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Kif28pD3YXS5 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Kif28pD3YXS5 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Kif28pD3YXS5 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Kif28pD3YXS5 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Kif28pD3YXS5 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Kif28pD3YXS5 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Kif28pD3YXS5 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Kif28pD3YXS5 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Kif28pD3YXS5 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Kif28pD3YXS5 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Kif28pD3YXS5 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Kif28pD3YXS5 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Kif28pD3YXS5 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Kif28pD3YXS5 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Kif28pD3YXS5 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Kif28pD3YXS5 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Kif28pD3YXS5 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Kif28pD3YXS5 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Kif28pD3YXS5 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Kif28pD3YXS5 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Kif28pD3YXS5 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Kif28pD3YXS5 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Kif28pD3YXS5 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Kif28pD3YXS5 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Kif28pD3YXS5 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Kif28pD3YXS5 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Kif28pD3YXS5 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Kif28pD3YXS5 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Kif28pD3YXS5 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Kif28pD3YXS5 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Kif28pD3YXS5 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Kif28pD3YXS5 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Kif28pD3YXS5 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Kif28pD3YXS5 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Kif28pD3YXS5 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Kif28pD3YXS5 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Kif28pD3YXS5 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Kif28pD3YXS5 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Kif28pD3YXS5 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Kif28pD3YXS5 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Kif28pD3YXS5 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Kif28pD3YXS5 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Kif28pD3YXS5 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Kif28pD3YXS5 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Kif28pD3YXS5 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Kif28pD3YXS5 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Kif28pD3YXS5 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Kif28pD3YXS5 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Kif28pD3YXS5 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Kif28pD3YXS5 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Kif28pD3YXS5 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Kif28pD3YXS5 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Kif28pD3YXS5 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Kif28pD3YXS5 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Kif28pD3YXS5 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Kif28pD3YXS5 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Kif28pD3YXS5 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Kif28pD3YXS5 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Kif28pD3YXS5 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Kif28pD3YXS5 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Kif28pD3YXS5 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Kif28pD3YXS5 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Kif28pD3YXS5 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Kif28pD3YXS5 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Kif28pD3YXS5 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Kif28pD3YXS5 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Kif28pD3YXS5 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Kif28pD3YXS5 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Kif28pD3YXS5 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Kif28pD3YXS5 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Kif28pD3YXS5 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Kif28pD3YXS5 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Kif28pD3YXS5 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Kif28pD3YXS5 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Kif28pD3YXS5 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Kif28pD3YXS5 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Kif28pD3YXS5 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Kif28pD3YXS5 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Kif28pD3YXS5 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Kif28pD3YXS5 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Kif28pD3YXS5 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Kif28pD3YXS5 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Kif28pD3YXS5 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Kif28pD3YXS5 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Kif28pD3YXS5 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms