Protein–RNA interactions for Protein: D3YXL0

Ccdc170, Coiled-coil domain-containing 170, mousemouse

Predictions only

Length 722 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc170D3YXL0 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc170D3YXL0 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc170D3YXL0 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc170D3YXL0 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc170D3YXL0 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc170D3YXL0 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc170D3YXL0 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc170D3YXL0 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc170D3YXL0 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc170D3YXL0 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc170D3YXL0 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc170D3YXL0 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc170D3YXL0 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc170D3YXL0 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc170D3YXL0 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc170D3YXL0 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc170D3YXL0 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc170D3YXL0 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc170D3YXL0 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc170D3YXL0 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc170D3YXL0 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc170D3YXL0 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc170D3YXL0 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc170D3YXL0 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc170D3YXL0 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc170D3YXL0 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc170D3YXL0 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc170D3YXL0 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc170D3YXL0 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc170D3YXL0 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc170D3YXL0 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc170D3YXL0 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc170D3YXL0 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc170D3YXL0 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc170D3YXL0 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc170D3YXL0 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc170D3YXL0 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc170D3YXL0 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc170D3YXL0 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc170D3YXL0 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc170D3YXL0 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc170D3YXL0 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc170D3YXL0 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc170D3YXL0 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc170D3YXL0 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc170D3YXL0 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc170D3YXL0 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc170D3YXL0 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc170D3YXL0 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc170D3YXL0 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc170D3YXL0 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc170D3YXL0 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc170D3YXL0 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccdc170D3YXL0 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccdc170D3YXL0 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccdc170D3YXL0 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccdc170D3YXL0 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccdc170D3YXL0 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccdc170D3YXL0 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccdc170D3YXL0 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccdc170D3YXL0 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccdc170D3YXL0 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccdc170D3YXL0 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccdc170D3YXL0 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccdc170D3YXL0 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccdc170D3YXL0 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccdc170D3YXL0 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc170D3YXL0 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc170D3YXL0 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc170D3YXL0 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc170D3YXL0 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc170D3YXL0 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc170D3YXL0 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc170D3YXL0 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc170D3YXL0 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc170D3YXL0 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc170D3YXL0 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc170D3YXL0 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc170D3YXL0 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc170D3YXL0 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc170D3YXL0 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc170D3YXL0 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc170D3YXL0 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc170D3YXL0 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc170D3YXL0 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc170D3YXL0 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc170D3YXL0 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc170D3YXL0 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc170D3YXL0 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc170D3YXL0 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc170D3YXL0 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc170D3YXL0 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc170D3YXL0 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc170D3YXL0 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc170D3YXL0 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc170D3YXL0 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc170D3YXL0 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc170D3YXL0 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc170D3YXL0 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc170D3YXL0 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms