Protein–RNA interactions for Protein: D3YWX3

9230113P08Rik, RIKEN cDNA 9230113P08 gene, mousemouse

Predictions only

Length 137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
9230113P08RikD3YWX3 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
9230113P08RikD3YWX3 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
9230113P08RikD3YWX3 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
9230113P08RikD3YWX3 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
9230113P08RikD3YWX3 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
9230113P08RikD3YWX3 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
9230113P08RikD3YWX3 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
9230113P08RikD3YWX3 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
9230113P08RikD3YWX3 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
9230113P08RikD3YWX3 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
9230113P08RikD3YWX3 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
9230113P08RikD3YWX3 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
9230113P08RikD3YWX3 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
9230113P08RikD3YWX3 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
9230113P08RikD3YWX3 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
9230113P08RikD3YWX3 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
9230113P08RikD3YWX3 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
9230113P08RikD3YWX3 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
9230113P08RikD3YWX3 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
9230113P08RikD3YWX3 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
9230113P08RikD3YWX3 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
9230113P08RikD3YWX3 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
9230113P08RikD3YWX3 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
9230113P08RikD3YWX3 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
9230113P08RikD3YWX3 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
9230113P08RikD3YWX3 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
9230113P08RikD3YWX3 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
9230113P08RikD3YWX3 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
9230113P08RikD3YWX3 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
9230113P08RikD3YWX3 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
9230113P08RikD3YWX3 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
9230113P08RikD3YWX3 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
9230113P08RikD3YWX3 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
9230113P08RikD3YWX3 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
9230113P08RikD3YWX3 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
9230113P08RikD3YWX3 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
9230113P08RikD3YWX3 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
9230113P08RikD3YWX3 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
9230113P08RikD3YWX3 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
9230113P08RikD3YWX3 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
9230113P08RikD3YWX3 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
9230113P08RikD3YWX3 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
9230113P08RikD3YWX3 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
9230113P08RikD3YWX3 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
9230113P08RikD3YWX3 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
9230113P08RikD3YWX3 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
9230113P08RikD3YWX3 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
9230113P08RikD3YWX3 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
9230113P08RikD3YWX3 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
9230113P08RikD3YWX3 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
9230113P08RikD3YWX3 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
9230113P08RikD3YWX3 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
9230113P08RikD3YWX3 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
9230113P08RikD3YWX3 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
9230113P08RikD3YWX3 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
9230113P08RikD3YWX3 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
9230113P08RikD3YWX3 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
9230113P08RikD3YWX3 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
9230113P08RikD3YWX3 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
9230113P08RikD3YWX3 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
9230113P08RikD3YWX3 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
9230113P08RikD3YWX3 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
9230113P08RikD3YWX3 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
9230113P08RikD3YWX3 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
9230113P08RikD3YWX3 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
9230113P08RikD3YWX3 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
9230113P08RikD3YWX3 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
9230113P08RikD3YWX3 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
9230113P08RikD3YWX3 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
9230113P08RikD3YWX3 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
9230113P08RikD3YWX3 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
9230113P08RikD3YWX3 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
9230113P08RikD3YWX3 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
9230113P08RikD3YWX3 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
9230113P08RikD3YWX3 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
9230113P08RikD3YWX3 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
9230113P08RikD3YWX3 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
9230113P08RikD3YWX3 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
9230113P08RikD3YWX3 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
9230113P08RikD3YWX3 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
9230113P08RikD3YWX3 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
9230113P08RikD3YWX3 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
9230113P08RikD3YWX3 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
9230113P08RikD3YWX3 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
9230113P08RikD3YWX3 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
9230113P08RikD3YWX3 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
9230113P08RikD3YWX3 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
9230113P08RikD3YWX3 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
9230113P08RikD3YWX3 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
9230113P08RikD3YWX3 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
9230113P08RikD3YWX3 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
9230113P08RikD3YWX3 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
9230113P08RikD3YWX3 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
9230113P08RikD3YWX3 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
9230113P08RikD3YWX3 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
9230113P08RikD3YWX3 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
9230113P08RikD3YWX3 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
9230113P08RikD3YWX3 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
9230113P08RikD3YWX3 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
9230113P08RikD3YWX3 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms