Protein–RNA interactions for Protein: D3YUK0

Gm3259, Predicted gene 3259, mousemouse

Predictions only

Length 475 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3259D3YUK0 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm3259D3YUK0 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm3259D3YUK0 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm3259D3YUK0 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm3259D3YUK0 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm3259D3YUK0 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm3259D3YUK0 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm3259D3YUK0 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm3259D3YUK0 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm3259D3YUK0 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm3259D3YUK0 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm3259D3YUK0 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm3259D3YUK0 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm3259D3YUK0 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm3259D3YUK0 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm3259D3YUK0 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm3259D3YUK0 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm3259D3YUK0 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm3259D3YUK0 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm3259D3YUK0 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm3259D3YUK0 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm3259D3YUK0 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm3259D3YUK0 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm3259D3YUK0 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm3259D3YUK0 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm3259D3YUK0 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm3259D3YUK0 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm3259D3YUK0 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm3259D3YUK0 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm3259D3YUK0 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm3259D3YUK0 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm3259D3YUK0 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm3259D3YUK0 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm3259D3YUK0 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm3259D3YUK0 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm3259D3YUK0 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm3259D3YUK0 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm3259D3YUK0 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm3259D3YUK0 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm3259D3YUK0 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm3259D3YUK0 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm3259D3YUK0 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm3259D3YUK0 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm3259D3YUK0 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm3259D3YUK0 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm3259D3YUK0 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm3259D3YUK0 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm3259D3YUK0 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm3259D3YUK0 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm3259D3YUK0 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm3259D3YUK0 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm3259D3YUK0 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm3259D3YUK0 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm3259D3YUK0 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm3259D3YUK0 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm3259D3YUK0 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm3259D3YUK0 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm3259D3YUK0 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm3259D3YUK0 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm3259D3YUK0 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm3259D3YUK0 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm3259D3YUK0 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm3259D3YUK0 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm3259D3YUK0 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm3259D3YUK0 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm3259D3YUK0 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm3259D3YUK0 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm3259D3YUK0 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm3259D3YUK0 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm3259D3YUK0 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm3259D3YUK0 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm3259D3YUK0 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm3259D3YUK0 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm3259D3YUK0 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm3259D3YUK0 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm3259D3YUK0 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm3259D3YUK0 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm3259D3YUK0 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm3259D3YUK0 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm3259D3YUK0 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm3259D3YUK0 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm3259D3YUK0 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm3259D3YUK0 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm3259D3YUK0 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm3259D3YUK0 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm3259D3YUK0 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm3259D3YUK0 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm3259D3YUK0 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm3259D3YUK0 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm3259D3YUK0 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm3259D3YUK0 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm3259D3YUK0 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm3259D3YUK0 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm3259D3YUK0 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm3259D3YUK0 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm3259D3YUK0 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm3259D3YUK0 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm3259D3YUK0 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm3259D3YUK0 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm3259D3YUK0 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms