Protein–RNA interactions for Protein: C6EQI3

Gm17333, ASL1 fusion protein, mousemouse

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Length 125 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17333C6EQI3 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm17333C6EQI3 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm17333C6EQI3 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm17333C6EQI3 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm17333C6EQI3 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm17333C6EQI3 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm17333C6EQI3 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm17333C6EQI3 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm17333C6EQI3 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm17333C6EQI3 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm17333C6EQI3 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm17333C6EQI3 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm17333C6EQI3 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm17333C6EQI3 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm17333C6EQI3 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm17333C6EQI3 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm17333C6EQI3 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm17333C6EQI3 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm17333C6EQI3 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm17333C6EQI3 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm17333C6EQI3 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm17333C6EQI3 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm17333C6EQI3 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm17333C6EQI3 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm17333C6EQI3 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm17333C6EQI3 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm17333C6EQI3 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm17333C6EQI3 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm17333C6EQI3 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm17333C6EQI3 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm17333C6EQI3 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm17333C6EQI3 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm17333C6EQI3 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm17333C6EQI3 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm17333C6EQI3 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm17333C6EQI3 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm17333C6EQI3 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm17333C6EQI3 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm17333C6EQI3 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm17333C6EQI3 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm17333C6EQI3 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm17333C6EQI3 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm17333C6EQI3 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm17333C6EQI3 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm17333C6EQI3 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm17333C6EQI3 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm17333C6EQI3 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm17333C6EQI3 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm17333C6EQI3 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm17333C6EQI3 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm17333C6EQI3 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm17333C6EQI3 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm17333C6EQI3 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm17333C6EQI3 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm17333C6EQI3 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm17333C6EQI3 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm17333C6EQI3 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm17333C6EQI3 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm17333C6EQI3 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm17333C6EQI3 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm17333C6EQI3 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm17333C6EQI3 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm17333C6EQI3 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm17333C6EQI3 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Gm17333C6EQI3 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Gm17333C6EQI3 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Gm17333C6EQI3 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Gm17333C6EQI3 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
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Gm17333C6EQI3 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Gm17333C6EQI3 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm17333C6EQI3 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm17333C6EQI3 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm17333C6EQI3 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm17333C6EQI3 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm17333C6EQI3 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm17333C6EQI3 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm17333C6EQI3 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm17333C6EQI3 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm17333C6EQI3 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm17333C6EQI3 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm17333C6EQI3 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm17333C6EQI3 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm17333C6EQI3 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm17333C6EQI3 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm17333C6EQI3 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm17333C6EQI3 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm17333C6EQI3 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm17333C6EQI3 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm17333C6EQI3 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm17333C6EQI3 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm17333C6EQI3 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm17333C6EQI3 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm17333C6EQI3 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm17333C6EQI3 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm17333C6EQI3 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm17333C6EQI3 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm17333C6EQI3 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm17333C6EQI3 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm17333C6EQI3 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
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