Protein–RNA interactions for Protein: C0LLJ0

Kpna7, Importin subunit alpha-8, mousemouse

Predictions only

Length 499 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kpna7C0LLJ0 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kpna7C0LLJ0 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kpna7C0LLJ0 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kpna7C0LLJ0 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kpna7C0LLJ0 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kpna7C0LLJ0 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kpna7C0LLJ0 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kpna7C0LLJ0 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kpna7C0LLJ0 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kpna7C0LLJ0 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kpna7C0LLJ0 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kpna7C0LLJ0 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kpna7C0LLJ0 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kpna7C0LLJ0 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kpna7C0LLJ0 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kpna7C0LLJ0 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kpna7C0LLJ0 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kpna7C0LLJ0 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kpna7C0LLJ0 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kpna7C0LLJ0 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kpna7C0LLJ0 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kpna7C0LLJ0 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kpna7C0LLJ0 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kpna7C0LLJ0 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kpna7C0LLJ0 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kpna7C0LLJ0 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kpna7C0LLJ0 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kpna7C0LLJ0 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kpna7C0LLJ0 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Kpna7C0LLJ0 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kpna7C0LLJ0 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kpna7C0LLJ0 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kpna7C0LLJ0 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kpna7C0LLJ0 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kpna7C0LLJ0 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kpna7C0LLJ0 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kpna7C0LLJ0 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kpna7C0LLJ0 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kpna7C0LLJ0 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kpna7C0LLJ0 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kpna7C0LLJ0 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kpna7C0LLJ0 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kpna7C0LLJ0 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kpna7C0LLJ0 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kpna7C0LLJ0 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kpna7C0LLJ0 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kpna7C0LLJ0 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kpna7C0LLJ0 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kpna7C0LLJ0 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kpna7C0LLJ0 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kpna7C0LLJ0 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kpna7C0LLJ0 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kpna7C0LLJ0 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kpna7C0LLJ0 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kpna7C0LLJ0 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kpna7C0LLJ0 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kpna7C0LLJ0 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kpna7C0LLJ0 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kpna7C0LLJ0 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kpna7C0LLJ0 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kpna7C0LLJ0 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Kpna7C0LLJ0 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Kpna7C0LLJ0 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kpna7C0LLJ0 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kpna7C0LLJ0 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kpna7C0LLJ0 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kpna7C0LLJ0 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kpna7C0LLJ0 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kpna7C0LLJ0 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kpna7C0LLJ0 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kpna7C0LLJ0 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kpna7C0LLJ0 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kpna7C0LLJ0 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kpna7C0LLJ0 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kpna7C0LLJ0 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kpna7C0LLJ0 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kpna7C0LLJ0 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Kpna7C0LLJ0 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Kpna7C0LLJ0 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Kpna7C0LLJ0 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Kpna7C0LLJ0 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Kpna7C0LLJ0 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Kpna7C0LLJ0 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Kpna7C0LLJ0 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Kpna7C0LLJ0 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Kpna7C0LLJ0 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Kpna7C0LLJ0 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Kpna7C0LLJ0 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Kpna7C0LLJ0 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Kpna7C0LLJ0 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Kpna7C0LLJ0 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Kpna7C0LLJ0 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Kpna7C0LLJ0 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Kpna7C0LLJ0 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Kpna7C0LLJ0 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Kpna7C0LLJ0 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Kpna7C0LLJ0 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Kpna7C0LLJ0 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Kpna7C0LLJ0 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Kpna7C0LLJ0 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms