Protein–RNA interactions for Protein: C0HKC9

Smok3b, Sperm motility kinase 3B, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smok3bC0HKC9 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smok3bC0HKC9 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smok3bC0HKC9 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smok3bC0HKC9 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smok3bC0HKC9 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smok3bC0HKC9 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smok3bC0HKC9 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smok3bC0HKC9 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smok3bC0HKC9 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smok3bC0HKC9 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smok3bC0HKC9 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smok3bC0HKC9 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smok3bC0HKC9 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smok3bC0HKC9 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smok3bC0HKC9 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smok3bC0HKC9 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smok3bC0HKC9 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smok3bC0HKC9 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smok3bC0HKC9 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smok3bC0HKC9 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Smok3bC0HKC9 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smok3bC0HKC9 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Smok3bC0HKC9 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smok3bC0HKC9 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smok3bC0HKC9 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smok3bC0HKC9 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smok3bC0HKC9 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smok3bC0HKC9 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smok3bC0HKC9 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smok3bC0HKC9 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smok3bC0HKC9 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smok3bC0HKC9 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smok3bC0HKC9 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smok3bC0HKC9 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Smok3bC0HKC9 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smok3bC0HKC9 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smok3bC0HKC9 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smok3bC0HKC9 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smok3bC0HKC9 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smok3bC0HKC9 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smok3bC0HKC9 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smok3bC0HKC9 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Smok3bC0HKC9 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smok3bC0HKC9 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smok3bC0HKC9 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smok3bC0HKC9 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smok3bC0HKC9 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smok3bC0HKC9 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smok3bC0HKC9 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smok3bC0HKC9 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smok3bC0HKC9 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smok3bC0HKC9 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smok3bC0HKC9 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smok3bC0HKC9 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smok3bC0HKC9 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Smok3bC0HKC9 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smok3bC0HKC9 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smok3bC0HKC9 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smok3bC0HKC9 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smok3bC0HKC9 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smok3bC0HKC9 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smok3bC0HKC9 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smok3bC0HKC9 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smok3bC0HKC9 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smok3bC0HKC9 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smok3bC0HKC9 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smok3bC0HKC9 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smok3bC0HKC9 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smok3bC0HKC9 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smok3bC0HKC9 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smok3bC0HKC9 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smok3bC0HKC9 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smok3bC0HKC9 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smok3bC0HKC9 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smok3bC0HKC9 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smok3bC0HKC9 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smok3bC0HKC9 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Smok3bC0HKC9 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
Smok3bC0HKC9 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Smok3bC0HKC9 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Smok3bC0HKC9 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smok3bC0HKC9 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smok3bC0HKC9 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smok3bC0HKC9 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smok3bC0HKC9 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smok3bC0HKC9 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smok3bC0HKC9 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smok3bC0HKC9 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smok3bC0HKC9 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Smok3bC0HKC9 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smok3bC0HKC9 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smok3bC0HKC9 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smok3bC0HKC9 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smok3bC0HKC9 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Smok3bC0HKC9 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smok3bC0HKC9 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smok3bC0HKC9 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smok3bC0HKC9 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smok3bC0HKC9 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smok3bC0HKC9 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.4 ms