Protein–RNA interactions for Protein: B8JJN0

Gm20547, Predicted gene 20547, mousemouse

Predictions only

Length 1,276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20547B8JJN0 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm20547B8JJN0 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm20547B8JJN0 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm20547B8JJN0 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm20547B8JJN0 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm20547B8JJN0 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm20547B8JJN0 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm20547B8JJN0 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm20547B8JJN0 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm20547B8JJN0 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm20547B8JJN0 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm20547B8JJN0 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm20547B8JJN0 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm20547B8JJN0 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm20547B8JJN0 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm20547B8JJN0 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm20547B8JJN0 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm20547B8JJN0 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm20547B8JJN0 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm20547B8JJN0 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm20547B8JJN0 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm20547B8JJN0 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm20547B8JJN0 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm20547B8JJN0 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm20547B8JJN0 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm20547B8JJN0 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm20547B8JJN0 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm20547B8JJN0 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm20547B8JJN0 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm20547B8JJN0 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm20547B8JJN0 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm20547B8JJN0 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm20547B8JJN0 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm20547B8JJN0 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm20547B8JJN0 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm20547B8JJN0 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm20547B8JJN0 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm20547B8JJN0 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm20547B8JJN0 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm20547B8JJN0 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm20547B8JJN0 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm20547B8JJN0 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm20547B8JJN0 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm20547B8JJN0 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm20547B8JJN0 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm20547B8JJN0 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm20547B8JJN0 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm20547B8JJN0 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm20547B8JJN0 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm20547B8JJN0 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm20547B8JJN0 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm20547B8JJN0 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm20547B8JJN0 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm20547B8JJN0 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm20547B8JJN0 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm20547B8JJN0 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm20547B8JJN0 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm20547B8JJN0 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm20547B8JJN0 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm20547B8JJN0 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm20547B8JJN0 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm20547B8JJN0 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm20547B8JJN0 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm20547B8JJN0 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm20547B8JJN0 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm20547B8JJN0 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm20547B8JJN0 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm20547B8JJN0 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm20547B8JJN0 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm20547B8JJN0 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm20547B8JJN0 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm20547B8JJN0 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm20547B8JJN0 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm20547B8JJN0 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm20547B8JJN0 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm20547B8JJN0 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm20547B8JJN0 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm20547B8JJN0 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm20547B8JJN0 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm20547B8JJN0 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm20547B8JJN0 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm20547B8JJN0 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm20547B8JJN0 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm20547B8JJN0 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm20547B8JJN0 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm20547B8JJN0 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm20547B8JJN0 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm20547B8JJN0 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm20547B8JJN0 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm20547B8JJN0 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm20547B8JJN0 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm20547B8JJN0 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm20547B8JJN0 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm20547B8JJN0 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm20547B8JJN0 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm20547B8JJN0 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm20547B8JJN0 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm20547B8JJN0 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm20547B8JJN0 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm20547B8JJN0 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms