Protein–RNA interactions for Protein: B2RV38

Rd3l, BC048943 protein, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rd3lB2RV38 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rd3lB2RV38 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rd3lB2RV38 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rd3lB2RV38 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rd3lB2RV38 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rd3lB2RV38 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rd3lB2RV38 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rd3lB2RV38 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rd3lB2RV38 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rd3lB2RV38 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rd3lB2RV38 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rd3lB2RV38 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rd3lB2RV38 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rd3lB2RV38 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rd3lB2RV38 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rd3lB2RV38 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rd3lB2RV38 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rd3lB2RV38 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rd3lB2RV38 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rd3lB2RV38 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rd3lB2RV38 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rd3lB2RV38 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rd3lB2RV38 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rd3lB2RV38 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rd3lB2RV38 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rd3lB2RV38 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rd3lB2RV38 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rd3lB2RV38 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rd3lB2RV38 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rd3lB2RV38 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rd3lB2RV38 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rd3lB2RV38 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rd3lB2RV38 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rd3lB2RV38 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Rd3lB2RV38 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rd3lB2RV38 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rd3lB2RV38 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rd3lB2RV38 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rd3lB2RV38 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rd3lB2RV38 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rd3lB2RV38 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rd3lB2RV38 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rd3lB2RV38 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rd3lB2RV38 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rd3lB2RV38 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rd3lB2RV38 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rd3lB2RV38 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rd3lB2RV38 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rd3lB2RV38 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rd3lB2RV38 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rd3lB2RV38 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rd3lB2RV38 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Rd3lB2RV38 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rd3lB2RV38 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rd3lB2RV38 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rd3lB2RV38 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rd3lB2RV38 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rd3lB2RV38 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rd3lB2RV38 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rd3lB2RV38 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rd3lB2RV38 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rd3lB2RV38 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rd3lB2RV38 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rd3lB2RV38 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rd3lB2RV38 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rd3lB2RV38 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rd3lB2RV38 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rd3lB2RV38 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rd3lB2RV38 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rd3lB2RV38 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rd3lB2RV38 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rd3lB2RV38 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rd3lB2RV38 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rd3lB2RV38 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rd3lB2RV38 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rd3lB2RV38 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rd3lB2RV38 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rd3lB2RV38 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rd3lB2RV38 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rd3lB2RV38 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rd3lB2RV38 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rd3lB2RV38 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rd3lB2RV38 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rd3lB2RV38 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rd3lB2RV38 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rd3lB2RV38 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rd3lB2RV38 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rd3lB2RV38 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rd3lB2RV38 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rd3lB2RV38 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rd3lB2RV38 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rd3lB2RV38 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rd3lB2RV38 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rd3lB2RV38 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rd3lB2RV38 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rd3lB2RV38 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rd3lB2RV38 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rd3lB2RV38 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rd3lB2RV38 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rd3lB2RV38 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms