Protein–RNA interactions for Protein: B2RRD7

Brpf1, Peregrin, mousemouse

Predictions only

Length 1,212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brpf1B2RRD7 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Brpf1B2RRD7 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Brpf1B2RRD7 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Brpf1B2RRD7 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Brpf1B2RRD7 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Brpf1B2RRD7 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Brpf1B2RRD7 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Brpf1B2RRD7 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Brpf1B2RRD7 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Brpf1B2RRD7 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Brpf1B2RRD7 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Brpf1B2RRD7 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Brpf1B2RRD7 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Brpf1B2RRD7 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Brpf1B2RRD7 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Brpf1B2RRD7 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Brpf1B2RRD7 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Brpf1B2RRD7 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Brpf1B2RRD7 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Brpf1B2RRD7 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Brpf1B2RRD7 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Brpf1B2RRD7 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Brpf1B2RRD7 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Brpf1B2RRD7 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Brpf1B2RRD7 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Brpf1B2RRD7 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Brpf1B2RRD7 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Brpf1B2RRD7 AC154532.1-201ENSMUST00000227860 965 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Brpf1B2RRD7 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Brpf1B2RRD7 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Brpf1B2RRD7 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Brpf1B2RRD7 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Brpf1B2RRD7 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Brpf1B2RRD7 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Brpf1B2RRD7 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Brpf1B2RRD7 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Brpf1B2RRD7 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Brpf1B2RRD7 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Brpf1B2RRD7 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Brpf1B2RRD7 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Brpf1B2RRD7 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Brpf1B2RRD7 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Brpf1B2RRD7 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Brpf1B2RRD7 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Brpf1B2RRD7 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
Brpf1B2RRD7 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Brpf1B2RRD7 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Brpf1B2RRD7 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Brpf1B2RRD7 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Brpf1B2RRD7 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Brpf1B2RRD7 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Brpf1B2RRD7 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Brpf1B2RRD7 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Brpf1B2RRD7 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Brpf1B2RRD7 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Brpf1B2RRD7 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Brpf1B2RRD7 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Brpf1B2RRD7 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Brpf1B2RRD7 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Brpf1B2RRD7 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Brpf1B2RRD7 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Brpf1B2RRD7 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Brpf1B2RRD7 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Brpf1B2RRD7 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Brpf1B2RRD7 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Brpf1B2RRD7 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Brpf1B2RRD7 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Brpf1B2RRD7 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Brpf1B2RRD7 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Brpf1B2RRD7 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Brpf1B2RRD7 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Brpf1B2RRD7 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Brpf1B2RRD7 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Brpf1B2RRD7 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Brpf1B2RRD7 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Brpf1B2RRD7 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Brpf1B2RRD7 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Brpf1B2RRD7 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Brpf1B2RRD7 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Brpf1B2RRD7 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Brpf1B2RRD7 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Brpf1B2RRD7 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Brpf1B2RRD7 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Brpf1B2RRD7 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Brpf1B2RRD7 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Brpf1B2RRD7 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Brpf1B2RRD7 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Brpf1B2RRD7 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Brpf1B2RRD7 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Brpf1B2RRD7 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Brpf1B2RRD7 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Brpf1B2RRD7 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Brpf1B2RRD7 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Brpf1B2RRD7 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Brpf1B2RRD7 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Brpf1B2RRD7 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Brpf1B2RRD7 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Brpf1B2RRD7 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Brpf1B2RRD7 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Brpf1B2RRD7 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms