Protein–RNA interactions for Protein: B1ASB6

Spocd1, SPOC domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spocd1B1ASB6 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Spocd1B1ASB6 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Spocd1B1ASB6 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Spocd1B1ASB6 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Spocd1B1ASB6 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Spocd1B1ASB6 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Spocd1B1ASB6 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Spocd1B1ASB6 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Spocd1B1ASB6 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Spocd1B1ASB6 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Spocd1B1ASB6 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Spocd1B1ASB6 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Spocd1B1ASB6 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Spocd1B1ASB6 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Spocd1B1ASB6 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Spocd1B1ASB6 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Spocd1B1ASB6 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Spocd1B1ASB6 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Spocd1B1ASB6 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Spocd1B1ASB6 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Spocd1B1ASB6 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Spocd1B1ASB6 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Spocd1B1ASB6 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Spocd1B1ASB6 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Spocd1B1ASB6 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Spocd1B1ASB6 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Spocd1B1ASB6 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Spocd1B1ASB6 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Spocd1B1ASB6 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Spocd1B1ASB6 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Spocd1B1ASB6 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Spocd1B1ASB6 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Spocd1B1ASB6 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Spocd1B1ASB6 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Spocd1B1ASB6 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Spocd1B1ASB6 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Spocd1B1ASB6 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Spocd1B1ASB6 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Spocd1B1ASB6 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Spocd1B1ASB6 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Spocd1B1ASB6 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Spocd1B1ASB6 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Spocd1B1ASB6 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Spocd1B1ASB6 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Spocd1B1ASB6 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Spocd1B1ASB6 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Spocd1B1ASB6 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Spocd1B1ASB6 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Spocd1B1ASB6 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Spocd1B1ASB6 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Spocd1B1ASB6 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Spocd1B1ASB6 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Spocd1B1ASB6 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Spocd1B1ASB6 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Spocd1B1ASB6 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Spocd1B1ASB6 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Spocd1B1ASB6 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Spocd1B1ASB6 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Spocd1B1ASB6 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Spocd1B1ASB6 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Spocd1B1ASB6 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Spocd1B1ASB6 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Spocd1B1ASB6 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Spocd1B1ASB6 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Spocd1B1ASB6 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Spocd1B1ASB6 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Spocd1B1ASB6 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Spocd1B1ASB6 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Spocd1B1ASB6 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Spocd1B1ASB6 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Spocd1B1ASB6 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Spocd1B1ASB6 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Spocd1B1ASB6 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Spocd1B1ASB6 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Spocd1B1ASB6 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Spocd1B1ASB6 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Spocd1B1ASB6 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Spocd1B1ASB6 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Spocd1B1ASB6 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Spocd1B1ASB6 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Spocd1B1ASB6 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Spocd1B1ASB6 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Spocd1B1ASB6 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Spocd1B1ASB6 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Spocd1B1ASB6 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Spocd1B1ASB6 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Spocd1B1ASB6 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Spocd1B1ASB6 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Spocd1B1ASB6 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Spocd1B1ASB6 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Spocd1B1ASB6 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Spocd1B1ASB6 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Spocd1B1ASB6 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Spocd1B1ASB6 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Spocd1B1ASB6 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Spocd1B1ASB6 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Spocd1B1ASB6 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Spocd1B1ASB6 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Spocd1B1ASB6 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Spocd1B1ASB6 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms