Protein–RNA interactions for Protein: A9JSM3

Tmem238, Transmembrane protein 238, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem238A9JSM3 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmem238A9JSM3 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmem238A9JSM3 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmem238A9JSM3 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmem238A9JSM3 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmem238A9JSM3 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmem238A9JSM3 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmem238A9JSM3 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmem238A9JSM3 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmem238A9JSM3 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmem238A9JSM3 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmem238A9JSM3 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmem238A9JSM3 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmem238A9JSM3 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmem238A9JSM3 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmem238A9JSM3 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmem238A9JSM3 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmem238A9JSM3 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmem238A9JSM3 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmem238A9JSM3 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmem238A9JSM3 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmem238A9JSM3 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmem238A9JSM3 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmem238A9JSM3 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Tmem238A9JSM3 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Tmem238A9JSM3 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Tmem238A9JSM3 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Tmem238A9JSM3 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Tmem238A9JSM3 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Tmem238A9JSM3 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmem238A9JSM3 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmem238A9JSM3 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmem238A9JSM3 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmem238A9JSM3 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmem238A9JSM3 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmem238A9JSM3 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmem238A9JSM3 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmem238A9JSM3 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmem238A9JSM3 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmem238A9JSM3 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmem238A9JSM3 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmem238A9JSM3 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmem238A9JSM3 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmem238A9JSM3 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmem238A9JSM3 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmem238A9JSM3 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmem238A9JSM3 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmem238A9JSM3 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmem238A9JSM3 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmem238A9JSM3 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmem238A9JSM3 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmem238A9JSM3 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmem238A9JSM3 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmem238A9JSM3 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmem238A9JSM3 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmem238A9JSM3 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmem238A9JSM3 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmem238A9JSM3 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmem238A9JSM3 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmem238A9JSM3 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmem238A9JSM3 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmem238A9JSM3 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmem238A9JSM3 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmem238A9JSM3 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmem238A9JSM3 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmem238A9JSM3 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmem238A9JSM3 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmem238A9JSM3 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmem238A9JSM3 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmem238A9JSM3 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmem238A9JSM3 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmem238A9JSM3 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmem238A9JSM3 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmem238A9JSM3 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmem238A9JSM3 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmem238A9JSM3 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmem238A9JSM3 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmem238A9JSM3 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmem238A9JSM3 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmem238A9JSM3 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmem238A9JSM3 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmem238A9JSM3 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmem238A9JSM3 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmem238A9JSM3 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmem238A9JSM3 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmem238A9JSM3 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmem238A9JSM3 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmem238A9JSM3 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmem238A9JSM3 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmem238A9JSM3 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmem238A9JSM3 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmem238A9JSM3 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmem238A9JSM3 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmem238A9JSM3 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmem238A9JSM3 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmem238A9JSM3 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmem238A9JSM3 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmem238A9JSM3 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tmem238A9JSM3 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tmem238A9JSM3 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms