Protein–RNA interactions for Protein: A4UUI3

Gbp4, Guanylate binding protein 4.1, mousemouse

Predictions only

Length 631 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp4A4UUI3 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gbp4A4UUI3 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gbp4A4UUI3 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gbp4A4UUI3 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gbp4A4UUI3 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gbp4A4UUI3 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gbp4A4UUI3 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Gbp4A4UUI3 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gbp4A4UUI3 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gbp4A4UUI3 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gbp4A4UUI3 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gbp4A4UUI3 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gbp4A4UUI3 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gbp4A4UUI3 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gbp4A4UUI3 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gbp4A4UUI3 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gbp4A4UUI3 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gbp4A4UUI3 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gbp4A4UUI3 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gbp4A4UUI3 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gbp4A4UUI3 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gbp4A4UUI3 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gbp4A4UUI3 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gbp4A4UUI3 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gbp4A4UUI3 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gbp4A4UUI3 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gbp4A4UUI3 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gbp4A4UUI3 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gbp4A4UUI3 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gbp4A4UUI3 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gbp4A4UUI3 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gbp4A4UUI3 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gbp4A4UUI3 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gbp4A4UUI3 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gbp4A4UUI3 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Gbp4A4UUI3 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Gbp4A4UUI3 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gbp4A4UUI3 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gbp4A4UUI3 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gbp4A4UUI3 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gbp4A4UUI3 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gbp4A4UUI3 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gbp4A4UUI3 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gbp4A4UUI3 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gbp4A4UUI3 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gbp4A4UUI3 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gbp4A4UUI3 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gbp4A4UUI3 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gbp4A4UUI3 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gbp4A4UUI3 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gbp4A4UUI3 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gbp4A4UUI3 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gbp4A4UUI3 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gbp4A4UUI3 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gbp4A4UUI3 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gbp4A4UUI3 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gbp4A4UUI3 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gbp4A4UUI3 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gbp4A4UUI3 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gbp4A4UUI3 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gbp4A4UUI3 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Gbp4A4UUI3 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gbp4A4UUI3 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gbp4A4UUI3 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gbp4A4UUI3 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gbp4A4UUI3 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gbp4A4UUI3 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gbp4A4UUI3 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gbp4A4UUI3 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gbp4A4UUI3 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gbp4A4UUI3 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gbp4A4UUI3 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gbp4A4UUI3 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gbp4A4UUI3 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gbp4A4UUI3 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gbp4A4UUI3 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gbp4A4UUI3 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gbp4A4UUI3 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gbp4A4UUI3 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gbp4A4UUI3 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gbp4A4UUI3 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gbp4A4UUI3 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gbp4A4UUI3 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gbp4A4UUI3 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gbp4A4UUI3 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gbp4A4UUI3 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gbp4A4UUI3 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gbp4A4UUI3 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gbp4A4UUI3 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gbp4A4UUI3 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gbp4A4UUI3 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gbp4A4UUI3 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gbp4A4UUI3 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gbp4A4UUI3 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gbp4A4UUI3 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gbp4A4UUI3 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gbp4A4UUI3 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gbp4A4UUI3 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gbp4A4UUI3 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gbp4A4UUI3 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms