Protein–RNA interactions for Protein: A3KG45

Gm6880, MCG1035527 (Fragment), mousemouse

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Length 208 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6880A3KG45 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm6880A3KG45 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm6880A3KG45 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm6880A3KG45 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm6880A3KG45 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm6880A3KG45 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm6880A3KG45 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm6880A3KG45 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm6880A3KG45 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm6880A3KG45 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm6880A3KG45 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm6880A3KG45 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm6880A3KG45 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm6880A3KG45 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm6880A3KG45 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm6880A3KG45 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm6880A3KG45 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm6880A3KG45 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm6880A3KG45 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm6880A3KG45 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm6880A3KG45 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm6880A3KG45 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm6880A3KG45 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm6880A3KG45 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm6880A3KG45 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm6880A3KG45 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm6880A3KG45 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm6880A3KG45 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm6880A3KG45 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm6880A3KG45 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm6880A3KG45 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm6880A3KG45 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm6880A3KG45 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm6880A3KG45 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm6880A3KG45 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm6880A3KG45 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm6880A3KG45 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm6880A3KG45 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm6880A3KG45 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm6880A3KG45 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm6880A3KG45 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm6880A3KG45 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm6880A3KG45 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm6880A3KG45 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm6880A3KG45 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm6880A3KG45 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm6880A3KG45 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm6880A3KG45 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm6880A3KG45 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm6880A3KG45 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm6880A3KG45 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm6880A3KG45 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm6880A3KG45 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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Gm6880A3KG45 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm6880A3KG45 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm6880A3KG45 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm6880A3KG45 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm6880A3KG45 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm6880A3KG45 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm6880A3KG45 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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Gm6880A3KG45 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm6880A3KG45 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm6880A3KG45 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm6880A3KG45 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm6880A3KG45 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm6880A3KG45 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm6880A3KG45 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm6880A3KG45 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm6880A3KG45 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm6880A3KG45 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm6880A3KG45 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm6880A3KG45 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm6880A3KG45 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm6880A3KG45 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm6880A3KG45 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm6880A3KG45 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm6880A3KG45 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm6880A3KG45 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm6880A3KG45 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm6880A3KG45 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm6880A3KG45 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm6880A3KG45 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm6880A3KG45 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm6880A3KG45 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm6880A3KG45 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm6880A3KG45 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm6880A3KG45 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm6880A3KG45 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm6880A3KG45 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm6880A3KG45 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm6880A3KG45 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm6880A3KG45 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm6880A3KG45 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm6880A3KG45 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm6880A3KG45 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm6880A3KG45 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm6880A3KG45 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm6880A3KG45 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
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