Protein–RNA interactions for Protein: A3FIN4

Atp8b5, Phospholipid-transporting ATPase FetA, mousemouse

Predictions only

Length 1,183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b5A3FIN4 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Atp8b5A3FIN4 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Atp8b5A3FIN4 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Atp8b5A3FIN4 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Atp8b5A3FIN4 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Atp8b5A3FIN4 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Atp8b5A3FIN4 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Atp8b5A3FIN4 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Atp8b5A3FIN4 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Atp8b5A3FIN4 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Atp8b5A3FIN4 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Atp8b5A3FIN4 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Atp8b5A3FIN4 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Atp8b5A3FIN4 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Atp8b5A3FIN4 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Atp8b5A3FIN4 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Atp8b5A3FIN4 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Atp8b5A3FIN4 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Atp8b5A3FIN4 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Atp8b5A3FIN4 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Atp8b5A3FIN4 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Atp8b5A3FIN4 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Atp8b5A3FIN4 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Atp8b5A3FIN4 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Atp8b5A3FIN4 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Atp8b5A3FIN4 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Atp8b5A3FIN4 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Atp8b5A3FIN4 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Atp8b5A3FIN4 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Atp8b5A3FIN4 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Atp8b5A3FIN4 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Atp8b5A3FIN4 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Atp8b5A3FIN4 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Atp8b5A3FIN4 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Atp8b5A3FIN4 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Atp8b5A3FIN4 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Atp8b5A3FIN4 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Atp8b5A3FIN4 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Atp8b5A3FIN4 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Atp8b5A3FIN4 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Atp8b5A3FIN4 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Atp8b5A3FIN4 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Atp8b5A3FIN4 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Atp8b5A3FIN4 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Atp8b5A3FIN4 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Atp8b5A3FIN4 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Atp8b5A3FIN4 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Atp8b5A3FIN4 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Atp8b5A3FIN4 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Atp8b5A3FIN4 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Atp8b5A3FIN4 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Atp8b5A3FIN4 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Atp8b5A3FIN4 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Atp8b5A3FIN4 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Atp8b5A3FIN4 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Atp8b5A3FIN4 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Atp8b5A3FIN4 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Atp8b5A3FIN4 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Atp8b5A3FIN4 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Atp8b5A3FIN4 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Atp8b5A3FIN4 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Atp8b5A3FIN4 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Atp8b5A3FIN4 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Atp8b5A3FIN4 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Atp8b5A3FIN4 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Atp8b5A3FIN4 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Atp8b5A3FIN4 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Atp8b5A3FIN4 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Atp8b5A3FIN4 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Atp8b5A3FIN4 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Atp8b5A3FIN4 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Atp8b5A3FIN4 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Atp8b5A3FIN4 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Atp8b5A3FIN4 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Atp8b5A3FIN4 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Atp8b5A3FIN4 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Atp8b5A3FIN4 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Atp8b5A3FIN4 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Atp8b5A3FIN4 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Atp8b5A3FIN4 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Atp8b5A3FIN4 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Atp8b5A3FIN4 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Atp8b5A3FIN4 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Atp8b5A3FIN4 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Atp8b5A3FIN4 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Atp8b5A3FIN4 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Atp8b5A3FIN4 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Atp8b5A3FIN4 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Atp8b5A3FIN4 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Atp8b5A3FIN4 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Atp8b5A3FIN4 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Atp8b5A3FIN4 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Atp8b5A3FIN4 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Atp8b5A3FIN4 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Atp8b5A3FIN4 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Atp8b5A3FIN4 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Atp8b5A3FIN4 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Atp8b5A3FIN4 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Atp8b5A3FIN4 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Atp8b5A3FIN4 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58 ms