Protein–RNA interactions for Protein: A2BED8

Samt1, Predicted gene 10057, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samt1A2BED8 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Samt1A2BED8 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Samt1A2BED8 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Samt1A2BED8 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Samt1A2BED8 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Samt1A2BED8 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Samt1A2BED8 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Samt1A2BED8 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Samt1A2BED8 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Samt1A2BED8 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Samt1A2BED8 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Samt1A2BED8 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Samt1A2BED8 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Samt1A2BED8 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Samt1A2BED8 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Samt1A2BED8 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Samt1A2BED8 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Samt1A2BED8 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Samt1A2BED8 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Samt1A2BED8 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Samt1A2BED8 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Samt1A2BED8 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Samt1A2BED8 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Samt1A2BED8 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Samt1A2BED8 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Samt1A2BED8 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Samt1A2BED8 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Samt1A2BED8 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Samt1A2BED8 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Samt1A2BED8 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Samt1A2BED8 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Samt1A2BED8 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Samt1A2BED8 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Samt1A2BED8 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Samt1A2BED8 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Samt1A2BED8 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Samt1A2BED8 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Samt1A2BED8 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Samt1A2BED8 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Samt1A2BED8 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Samt1A2BED8 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Samt1A2BED8 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Samt1A2BED8 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Samt1A2BED8 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Samt1A2BED8 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Samt1A2BED8 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Samt1A2BED8 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Samt1A2BED8 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Samt1A2BED8 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Samt1A2BED8 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Samt1A2BED8 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Samt1A2BED8 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Samt1A2BED8 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Samt1A2BED8 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Samt1A2BED8 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Samt1A2BED8 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Samt1A2BED8 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Samt1A2BED8 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Samt1A2BED8 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Samt1A2BED8 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Samt1A2BED8 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Samt1A2BED8 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Samt1A2BED8 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Samt1A2BED8 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Samt1A2BED8 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Samt1A2BED8 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Samt1A2BED8 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Samt1A2BED8 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Samt1A2BED8 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Samt1A2BED8 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Samt1A2BED8 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Samt1A2BED8 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Samt1A2BED8 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Samt1A2BED8 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Samt1A2BED8 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Samt1A2BED8 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Samt1A2BED8 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Samt1A2BED8 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Samt1A2BED8 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Samt1A2BED8 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Samt1A2BED8 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Samt1A2BED8 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Samt1A2BED8 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Samt1A2BED8 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Samt1A2BED8 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Samt1A2BED8 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Samt1A2BED8 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Samt1A2BED8 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Samt1A2BED8 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Samt1A2BED8 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Samt1A2BED8 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Samt1A2BED8 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Samt1A2BED8 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Samt1A2BED8 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Samt1A2BED8 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Samt1A2BED8 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Samt1A2BED8 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Samt1A2BED8 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Samt1A2BED8 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Samt1A2BED8 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
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