Protein–RNA interactions for Protein: A2ARM1

Patl2, Protein PAT1 homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 529 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Patl2A2ARM1 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Patl2A2ARM1 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Patl2A2ARM1 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Patl2A2ARM1 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Patl2A2ARM1 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Patl2A2ARM1 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Patl2A2ARM1 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Patl2A2ARM1 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Patl2A2ARM1 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Patl2A2ARM1 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Patl2A2ARM1 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Patl2A2ARM1 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Patl2A2ARM1 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Patl2A2ARM1 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Patl2A2ARM1 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
Patl2A2ARM1 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Patl2A2ARM1 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Patl2A2ARM1 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Patl2A2ARM1 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Patl2A2ARM1 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Patl2A2ARM1 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Patl2A2ARM1 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Patl2A2ARM1 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Patl2A2ARM1 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Patl2A2ARM1 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Patl2A2ARM1 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Patl2A2ARM1 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Patl2A2ARM1 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Patl2A2ARM1 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Patl2A2ARM1 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Patl2A2ARM1 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Patl2A2ARM1 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Patl2A2ARM1 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Patl2A2ARM1 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Patl2A2ARM1 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Patl2A2ARM1 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Patl2A2ARM1 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Patl2A2ARM1 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Patl2A2ARM1 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Patl2A2ARM1 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Patl2A2ARM1 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Patl2A2ARM1 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Patl2A2ARM1 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Patl2A2ARM1 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Patl2A2ARM1 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Patl2A2ARM1 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Patl2A2ARM1 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Patl2A2ARM1 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Patl2A2ARM1 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Patl2A2ARM1 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Patl2A2ARM1 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Patl2A2ARM1 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Patl2A2ARM1 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Patl2A2ARM1 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Patl2A2ARM1 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Patl2A2ARM1 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Patl2A2ARM1 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Patl2A2ARM1 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Patl2A2ARM1 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Patl2A2ARM1 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Patl2A2ARM1 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Patl2A2ARM1 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Patl2A2ARM1 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Patl2A2ARM1 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Patl2A2ARM1 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Patl2A2ARM1 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Patl2A2ARM1 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Patl2A2ARM1 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Patl2A2ARM1 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Patl2A2ARM1 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Patl2A2ARM1 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Patl2A2ARM1 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Patl2A2ARM1 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Patl2A2ARM1 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Patl2A2ARM1 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Patl2A2ARM1 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Patl2A2ARM1 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Patl2A2ARM1 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Patl2A2ARM1 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Patl2A2ARM1 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Patl2A2ARM1 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Patl2A2ARM1 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Patl2A2ARM1 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Patl2A2ARM1 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Patl2A2ARM1 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Patl2A2ARM1 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Patl2A2ARM1 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Patl2A2ARM1 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Patl2A2ARM1 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Patl2A2ARM1 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Patl2A2ARM1 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Patl2A2ARM1 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Patl2A2ARM1 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Patl2A2ARM1 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Patl2A2ARM1 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Patl2A2ARM1 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Patl2A2ARM1 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Patl2A2ARM1 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Patl2A2ARM1 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Patl2A2ARM1 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.1 ms