Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ19

Rtf1, RNA polymerase-associated protein RTF1 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 715 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtf1A2AQ19 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rtf1A2AQ19 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rtf1A2AQ19 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rtf1A2AQ19 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rtf1A2AQ19 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rtf1A2AQ19 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rtf1A2AQ19 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rtf1A2AQ19 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rtf1A2AQ19 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rtf1A2AQ19 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rtf1A2AQ19 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rtf1A2AQ19 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Rtf1A2AQ19 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Rtf1A2AQ19 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rtf1A2AQ19 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rtf1A2AQ19 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rtf1A2AQ19 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rtf1A2AQ19 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rtf1A2AQ19 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rtf1A2AQ19 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rtf1A2AQ19 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rtf1A2AQ19 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rtf1A2AQ19 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rtf1A2AQ19 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rtf1A2AQ19 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Rtf1A2AQ19 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Rtf1A2AQ19 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rtf1A2AQ19 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rtf1A2AQ19 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rtf1A2AQ19 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rtf1A2AQ19 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rtf1A2AQ19 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rtf1A2AQ19 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rtf1A2AQ19 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rtf1A2AQ19 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rtf1A2AQ19 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rtf1A2AQ19 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rtf1A2AQ19 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Rtf1A2AQ19 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rtf1A2AQ19 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rtf1A2AQ19 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rtf1A2AQ19 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
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Rtf1A2AQ19 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rtf1A2AQ19 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
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Rtf1A2AQ19 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rtf1A2AQ19 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rtf1A2AQ19 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rtf1A2AQ19 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
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Rtf1A2AQ19 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rtf1A2AQ19 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
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Rtf1A2AQ19 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Rtf1A2AQ19 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Rtf1A2AQ19 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
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Rtf1A2AQ19 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
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Rtf1A2AQ19 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Rtf1A2AQ19 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rtf1A2AQ19 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rtf1A2AQ19 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rtf1A2AQ19 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
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Rtf1A2AQ19 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rtf1A2AQ19 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rtf1A2AQ19 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rtf1A2AQ19 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rtf1A2AQ19 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rtf1A2AQ19 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rtf1A2AQ19 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rtf1A2AQ19 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rtf1A2AQ19 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rtf1A2AQ19 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rtf1A2AQ19 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rtf1A2AQ19 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rtf1A2AQ19 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rtf1A2AQ19 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rtf1A2AQ19 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
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