Protein–RNA interactions for Protein: A2APF3

Ctcfl, Transcriptional repressor CTCFL, mousemouse

Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtcflA2APF3 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CtcflA2APF3 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CtcflA2APF3 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
CtcflA2APF3 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CtcflA2APF3 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CtcflA2APF3 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CtcflA2APF3 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CtcflA2APF3 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CtcflA2APF3 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CtcflA2APF3 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CtcflA2APF3 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CtcflA2APF3 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CtcflA2APF3 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CtcflA2APF3 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CtcflA2APF3 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CtcflA2APF3 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CtcflA2APF3 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CtcflA2APF3 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CtcflA2APF3 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CtcflA2APF3 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
CtcflA2APF3 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CtcflA2APF3 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
CtcflA2APF3 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
CtcflA2APF3 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.08
CtcflA2APF3 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CtcflA2APF3 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
CtcflA2APF3 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
CtcflA2APF3 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CtcflA2APF3 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CtcflA2APF3 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
CtcflA2APF3 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CtcflA2APF3 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CtcflA2APF3 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CtcflA2APF3 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CtcflA2APF3 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CtcflA2APF3 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CtcflA2APF3 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CtcflA2APF3 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CtcflA2APF3 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CtcflA2APF3 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CtcflA2APF3 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CtcflA2APF3 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CtcflA2APF3 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CtcflA2APF3 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CtcflA2APF3 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CtcflA2APF3 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CtcflA2APF3 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CtcflA2APF3 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CtcflA2APF3 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CtcflA2APF3 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CtcflA2APF3 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CtcflA2APF3 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CtcflA2APF3 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CtcflA2APF3 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CtcflA2APF3 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CtcflA2APF3 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CtcflA2APF3 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CtcflA2APF3 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CtcflA2APF3 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CtcflA2APF3 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CtcflA2APF3 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CtcflA2APF3 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
CtcflA2APF3 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
CtcflA2APF3 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CtcflA2APF3 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CtcflA2APF3 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CtcflA2APF3 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CtcflA2APF3 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CtcflA2APF3 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CtcflA2APF3 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CtcflA2APF3 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CtcflA2APF3 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CtcflA2APF3 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CtcflA2APF3 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CtcflA2APF3 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CtcflA2APF3 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CtcflA2APF3 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CtcflA2APF3 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CtcflA2APF3 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CtcflA2APF3 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CtcflA2APF3 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CtcflA2APF3 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CtcflA2APF3 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CtcflA2APF3 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CtcflA2APF3 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CtcflA2APF3 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CtcflA2APF3 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CtcflA2APF3 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CtcflA2APF3 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CtcflA2APF3 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
CtcflA2APF3 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CtcflA2APF3 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CtcflA2APF3 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CtcflA2APF3 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CtcflA2APF3 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CtcflA2APF3 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CtcflA2APF3 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CtcflA2APF3 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CtcflA2APF3 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CtcflA2APF3 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms