Protein–RNA interactions for Protein: A2AMW3

Gabre, Gamma-aminobutyric acid (GABA) A receptor, subunit epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GabreA2AMW3 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GabreA2AMW3 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GabreA2AMW3 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GabreA2AMW3 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GabreA2AMW3 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
GabreA2AMW3 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GabreA2AMW3 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GabreA2AMW3 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GabreA2AMW3 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GabreA2AMW3 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GabreA2AMW3 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GabreA2AMW3 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GabreA2AMW3 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GabreA2AMW3 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GabreA2AMW3 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GabreA2AMW3 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GabreA2AMW3 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GabreA2AMW3 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GabreA2AMW3 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GabreA2AMW3 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
GabreA2AMW3 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GabreA2AMW3 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GabreA2AMW3 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GabreA2AMW3 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GabreA2AMW3 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GabreA2AMW3 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GabreA2AMW3 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GabreA2AMW3 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GabreA2AMW3 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GabreA2AMW3 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
GabreA2AMW3 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
GabreA2AMW3 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
GabreA2AMW3 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GabreA2AMW3 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GabreA2AMW3 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GabreA2AMW3 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GabreA2AMW3 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GabreA2AMW3 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GabreA2AMW3 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GabreA2AMW3 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GabreA2AMW3 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GabreA2AMW3 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GabreA2AMW3 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GabreA2AMW3 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GabreA2AMW3 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GabreA2AMW3 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GabreA2AMW3 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GabreA2AMW3 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GabreA2AMW3 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GabreA2AMW3 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GabreA2AMW3 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GabreA2AMW3 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
GabreA2AMW3 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
GabreA2AMW3 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GabreA2AMW3 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
GabreA2AMW3 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
GabreA2AMW3 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GabreA2AMW3 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GabreA2AMW3 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GabreA2AMW3 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GabreA2AMW3 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GabreA2AMW3 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GabreA2AMW3 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GabreA2AMW3 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GabreA2AMW3 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GabreA2AMW3 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GabreA2AMW3 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GabreA2AMW3 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GabreA2AMW3 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GabreA2AMW3 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GabreA2AMW3 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GabreA2AMW3 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GabreA2AMW3 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GabreA2AMW3 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GabreA2AMW3 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GabreA2AMW3 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GabreA2AMW3 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
GabreA2AMW3 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GabreA2AMW3 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
GabreA2AMW3 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GabreA2AMW3 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GabreA2AMW3 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GabreA2AMW3 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GabreA2AMW3 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GabreA2AMW3 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GabreA2AMW3 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GabreA2AMW3 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GabreA2AMW3 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GabreA2AMW3 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GabreA2AMW3 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GabreA2AMW3 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GabreA2AMW3 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GabreA2AMW3 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
GabreA2AMW3 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
GabreA2AMW3 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
GabreA2AMW3 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GabreA2AMW3 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GabreA2AMW3 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GabreA2AMW3 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GabreA2AMW3 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms