Protein–RNA interactions for Protein: A2AM80

Fam43b, Family with sequence similarity 43, member B, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam43bA2AM80 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fam43bA2AM80 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Fam43bA2AM80 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fam43bA2AM80 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fam43bA2AM80 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fam43bA2AM80 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fam43bA2AM80 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fam43bA2AM80 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fam43bA2AM80 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fam43bA2AM80 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fam43bA2AM80 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fam43bA2AM80 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fam43bA2AM80 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fam43bA2AM80 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fam43bA2AM80 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fam43bA2AM80 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fam43bA2AM80 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fam43bA2AM80 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fam43bA2AM80 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fam43bA2AM80 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Fam43bA2AM80 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fam43bA2AM80 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Fam43bA2AM80 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Fam43bA2AM80 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fam43bA2AM80 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fam43bA2AM80 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fam43bA2AM80 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fam43bA2AM80 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fam43bA2AM80 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fam43bA2AM80 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fam43bA2AM80 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fam43bA2AM80 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fam43bA2AM80 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fam43bA2AM80 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fam43bA2AM80 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fam43bA2AM80 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fam43bA2AM80 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fam43bA2AM80 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fam43bA2AM80 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fam43bA2AM80 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fam43bA2AM80 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fam43bA2AM80 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Fam43bA2AM80 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fam43bA2AM80 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fam43bA2AM80 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fam43bA2AM80 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fam43bA2AM80 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fam43bA2AM80 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Fam43bA2AM80 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fam43bA2AM80 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fam43bA2AM80 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fam43bA2AM80 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Fam43bA2AM80 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fam43bA2AM80 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fam43bA2AM80 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fam43bA2AM80 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fam43bA2AM80 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fam43bA2AM80 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fam43bA2AM80 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fam43bA2AM80 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fam43bA2AM80 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fam43bA2AM80 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam43bA2AM80 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam43bA2AM80 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam43bA2AM80 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam43bA2AM80 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam43bA2AM80 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam43bA2AM80 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
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Fam43bA2AM80 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam43bA2AM80 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam43bA2AM80 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam43bA2AM80 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam43bA2AM80 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam43bA2AM80 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam43bA2AM80 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam43bA2AM80 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam43bA2AM80 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam43bA2AM80 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam43bA2AM80 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam43bA2AM80 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam43bA2AM80 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam43bA2AM80 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam43bA2AM80 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam43bA2AM80 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam43bA2AM80 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam43bA2AM80 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Fam43bA2AM80 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fam43bA2AM80 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Fam43bA2AM80 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fam43bA2AM80 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fam43bA2AM80 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fam43bA2AM80 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fam43bA2AM80 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fam43bA2AM80 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fam43bA2AM80 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fam43bA2AM80 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fam43bA2AM80 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 98.9 ms