Protein–RNA interactions for Protein: A2AFR3

Frmpd4, FERM and PDZ domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmpd4A2AFR3 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Frmpd4A2AFR3 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Frmpd4A2AFR3 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Frmpd4A2AFR3 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Frmpd4A2AFR3 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Frmpd4A2AFR3 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Frmpd4A2AFR3 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Frmpd4A2AFR3 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Frmpd4A2AFR3 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Frmpd4A2AFR3 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Frmpd4A2AFR3 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Frmpd4A2AFR3 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Frmpd4A2AFR3 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Frmpd4A2AFR3 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Frmpd4A2AFR3 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Frmpd4A2AFR3 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Frmpd4A2AFR3 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Frmpd4A2AFR3 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Frmpd4A2AFR3 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Frmpd4A2AFR3 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Frmpd4A2AFR3 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Frmpd4A2AFR3 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Frmpd4A2AFR3 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Frmpd4A2AFR3 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Frmpd4A2AFR3 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Frmpd4A2AFR3 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Frmpd4A2AFR3 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Frmpd4A2AFR3 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Frmpd4A2AFR3 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Frmpd4A2AFR3 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Frmpd4A2AFR3 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Frmpd4A2AFR3 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Frmpd4A2AFR3 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Frmpd4A2AFR3 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Frmpd4A2AFR3 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Frmpd4A2AFR3 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Frmpd4A2AFR3 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Frmpd4A2AFR3 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Frmpd4A2AFR3 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Frmpd4A2AFR3 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Frmpd4A2AFR3 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Frmpd4A2AFR3 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Frmpd4A2AFR3 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Frmpd4A2AFR3 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Frmpd4A2AFR3 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Frmpd4A2AFR3 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Frmpd4A2AFR3 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Frmpd4A2AFR3 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Frmpd4A2AFR3 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Frmpd4A2AFR3 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Frmpd4A2AFR3 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Frmpd4A2AFR3 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Frmpd4A2AFR3 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Frmpd4A2AFR3 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Frmpd4A2AFR3 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Frmpd4A2AFR3 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Frmpd4A2AFR3 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Frmpd4A2AFR3 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Frmpd4A2AFR3 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Frmpd4A2AFR3 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Frmpd4A2AFR3 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Frmpd4A2AFR3 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Frmpd4A2AFR3 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Frmpd4A2AFR3 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Frmpd4A2AFR3 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Frmpd4A2AFR3 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Frmpd4A2AFR3 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Frmpd4A2AFR3 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Frmpd4A2AFR3 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Frmpd4A2AFR3 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Frmpd4A2AFR3 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Frmpd4A2AFR3 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Frmpd4A2AFR3 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Frmpd4A2AFR3 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Frmpd4A2AFR3 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Frmpd4A2AFR3 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Frmpd4A2AFR3 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Frmpd4A2AFR3 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Frmpd4A2AFR3 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Frmpd4A2AFR3 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Frmpd4A2AFR3 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Frmpd4A2AFR3 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Frmpd4A2AFR3 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Frmpd4A2AFR3 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Frmpd4A2AFR3 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Frmpd4A2AFR3 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Frmpd4A2AFR3 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Frmpd4A2AFR3 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Frmpd4A2AFR3 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Frmpd4A2AFR3 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Frmpd4A2AFR3 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Frmpd4A2AFR3 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Frmpd4A2AFR3 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Frmpd4A2AFR3 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Frmpd4A2AFR3 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Frmpd4A2AFR3 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Frmpd4A2AFR3 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Frmpd4A2AFR3 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Frmpd4A2AFR3 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Frmpd4A2AFR3 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms