Protein–RNA interactions for Protein: A2AFR2

4930447F04Rik, RIKEN cDNA 4930447F04 gene, mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930447F04RikA2AFR2 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
4930447F04RikA2AFR2 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
4930447F04RikA2AFR2 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
4930447F04RikA2AFR2 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
4930447F04RikA2AFR2 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
4930447F04RikA2AFR2 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
4930447F04RikA2AFR2 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
4930447F04RikA2AFR2 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
4930447F04RikA2AFR2 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC11.79□□□□□ -0.52
4930447F04RikA2AFR2 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
4930447F04RikA2AFR2 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
4930447F04RikA2AFR2 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
4930447F04RikA2AFR2 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
4930447F04RikA2AFR2 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
4930447F04RikA2AFR2 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
4930447F04RikA2AFR2 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
4930447F04RikA2AFR2 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
4930447F04RikA2AFR2 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
4930447F04RikA2AFR2 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
4930447F04RikA2AFR2 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
4930447F04RikA2AFR2 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
4930447F04RikA2AFR2 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
4930447F04RikA2AFR2 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
4930447F04RikA2AFR2 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
4930447F04RikA2AFR2 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
4930447F04RikA2AFR2 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
4930447F04RikA2AFR2 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
4930447F04RikA2AFR2 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
4930447F04RikA2AFR2 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
4930447F04RikA2AFR2 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
4930447F04RikA2AFR2 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
4930447F04RikA2AFR2 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
4930447F04RikA2AFR2 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
4930447F04RikA2AFR2 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
4930447F04RikA2AFR2 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
4930447F04RikA2AFR2 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
4930447F04RikA2AFR2 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC11.78□□□□□ -0.52
4930447F04RikA2AFR2 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
4930447F04RikA2AFR2 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
4930447F04RikA2AFR2 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
4930447F04RikA2AFR2 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
4930447F04RikA2AFR2 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
4930447F04RikA2AFR2 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
4930447F04RikA2AFR2 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
4930447F04RikA2AFR2 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
4930447F04RikA2AFR2 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
4930447F04RikA2AFR2 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC11.78□□□□□ -0.52
4930447F04RikA2AFR2 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
4930447F04RikA2AFR2 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
4930447F04RikA2AFR2 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
4930447F04RikA2AFR2 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
4930447F04RikA2AFR2 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
4930447F04RikA2AFR2 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC11.78□□□□□ -0.52
4930447F04RikA2AFR2 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
4930447F04RikA2AFR2 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
4930447F04RikA2AFR2 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
4930447F04RikA2AFR2 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
4930447F04RikA2AFR2 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
4930447F04RikA2AFR2 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
4930447F04RikA2AFR2 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
4930447F04RikA2AFR2 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC11.78□□□□□ -0.52
4930447F04RikA2AFR2 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
4930447F04RikA2AFR2 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
4930447F04RikA2AFR2 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
4930447F04RikA2AFR2 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
4930447F04RikA2AFR2 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
4930447F04RikA2AFR2 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
4930447F04RikA2AFR2 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
4930447F04RikA2AFR2 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
4930447F04RikA2AFR2 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
4930447F04RikA2AFR2 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
4930447F04RikA2AFR2 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
4930447F04RikA2AFR2 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
4930447F04RikA2AFR2 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
4930447F04RikA2AFR2 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
4930447F04RikA2AFR2 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
4930447F04RikA2AFR2 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
4930447F04RikA2AFR2 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
4930447F04RikA2AFR2 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
4930447F04RikA2AFR2 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
4930447F04RikA2AFR2 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
4930447F04RikA2AFR2 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
4930447F04RikA2AFR2 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
4930447F04RikA2AFR2 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
4930447F04RikA2AFR2 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
4930447F04RikA2AFR2 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
4930447F04RikA2AFR2 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
4930447F04RikA2AFR2 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
4930447F04RikA2AFR2 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
4930447F04RikA2AFR2 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
4930447F04RikA2AFR2 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
4930447F04RikA2AFR2 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
4930447F04RikA2AFR2 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
4930447F04RikA2AFR2 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
4930447F04RikA2AFR2 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
4930447F04RikA2AFR2 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
4930447F04RikA2AFR2 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
4930447F04RikA2AFR2 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
4930447F04RikA2AFR2 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
4930447F04RikA2AFR2 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms