Protein–RNA interactions for Protein: A2ACT7

Col9a3, Collagen, type IX, alpha 3, mousemouse

Predictions only

Length 680 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col9a3A2ACT7 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Col9a3A2ACT7 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Col9a3A2ACT7 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Col9a3A2ACT7 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Col9a3A2ACT7 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Col9a3A2ACT7 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Col9a3A2ACT7 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Col9a3A2ACT7 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Col9a3A2ACT7 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col9a3A2ACT7 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col9a3A2ACT7 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col9a3A2ACT7 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col9a3A2ACT7 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col9a3A2ACT7 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col9a3A2ACT7 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col9a3A2ACT7 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col9a3A2ACT7 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col9a3A2ACT7 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col9a3A2ACT7 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col9a3A2ACT7 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col9a3A2ACT7 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col9a3A2ACT7 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col9a3A2ACT7 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col9a3A2ACT7 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col9a3A2ACT7 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col9a3A2ACT7 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col9a3A2ACT7 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col9a3A2ACT7 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col9a3A2ACT7 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col9a3A2ACT7 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col9a3A2ACT7 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col9a3A2ACT7 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col9a3A2ACT7 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col9a3A2ACT7 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col9a3A2ACT7 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col9a3A2ACT7 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col9a3A2ACT7 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col9a3A2ACT7 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col9a3A2ACT7 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Col9a3A2ACT7 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col9a3A2ACT7 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Col9a3A2ACT7 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Col9a3A2ACT7 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col9a3A2ACT7 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col9a3A2ACT7 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Col9a3A2ACT7 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col9a3A2ACT7 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col9a3A2ACT7 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col9a3A2ACT7 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col9a3A2ACT7 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col9a3A2ACT7 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col9a3A2ACT7 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col9a3A2ACT7 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col9a3A2ACT7 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col9a3A2ACT7 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col9a3A2ACT7 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Col9a3A2ACT7 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col9a3A2ACT7 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col9a3A2ACT7 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col9a3A2ACT7 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col9a3A2ACT7 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col9a3A2ACT7 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col9a3A2ACT7 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col9a3A2ACT7 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Col9a3A2ACT7 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Col9a3A2ACT7 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col9a3A2ACT7 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col9a3A2ACT7 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col9a3A2ACT7 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col9a3A2ACT7 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col9a3A2ACT7 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col9a3A2ACT7 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col9a3A2ACT7 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col9a3A2ACT7 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col9a3A2ACT7 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col9a3A2ACT7 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col9a3A2ACT7 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col9a3A2ACT7 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col9a3A2ACT7 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col9a3A2ACT7 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col9a3A2ACT7 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col9a3A2ACT7 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Col9a3A2ACT7 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Col9a3A2ACT7 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Col9a3A2ACT7 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Col9a3A2ACT7 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Col9a3A2ACT7 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Col9a3A2ACT7 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Col9a3A2ACT7 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Col9a3A2ACT7 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Col9a3A2ACT7 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Col9a3A2ACT7 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Col9a3A2ACT7 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Col9a3A2ACT7 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Col9a3A2ACT7 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Col9a3A2ACT7 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Col9a3A2ACT7 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Col9a3A2ACT7 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Col9a3A2ACT7 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Col9a3A2ACT7 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms