Protein–RNA interactions for Protein: A2ACP1

Ttc39a, Tetratricopeptide repeat protein 39A, mousemouse

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Length 578 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc39aA2ACP1 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ttc39aA2ACP1 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ttc39aA2ACP1 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ttc39aA2ACP1 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ttc39aA2ACP1 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ttc39aA2ACP1 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ttc39aA2ACP1 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ttc39aA2ACP1 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ttc39aA2ACP1 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ttc39aA2ACP1 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ttc39aA2ACP1 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ttc39aA2ACP1 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ttc39aA2ACP1 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ttc39aA2ACP1 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ttc39aA2ACP1 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ttc39aA2ACP1 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ttc39aA2ACP1 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ttc39aA2ACP1 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ttc39aA2ACP1 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ttc39aA2ACP1 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ttc39aA2ACP1 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ttc39aA2ACP1 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ttc39aA2ACP1 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ttc39aA2ACP1 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ttc39aA2ACP1 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ttc39aA2ACP1 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ttc39aA2ACP1 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ttc39aA2ACP1 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ttc39aA2ACP1 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ttc39aA2ACP1 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ttc39aA2ACP1 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ttc39aA2ACP1 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ttc39aA2ACP1 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ttc39aA2ACP1 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ttc39aA2ACP1 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ttc39aA2ACP1 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ttc39aA2ACP1 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ttc39aA2ACP1 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ttc39aA2ACP1 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ttc39aA2ACP1 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ttc39aA2ACP1 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ttc39aA2ACP1 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ttc39aA2ACP1 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ttc39aA2ACP1 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ttc39aA2ACP1 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ttc39aA2ACP1 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ttc39aA2ACP1 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ttc39aA2ACP1 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ttc39aA2ACP1 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ttc39aA2ACP1 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ttc39aA2ACP1 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ttc39aA2ACP1 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ttc39aA2ACP1 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ttc39aA2ACP1 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ttc39aA2ACP1 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ttc39aA2ACP1 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ttc39aA2ACP1 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ttc39aA2ACP1 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ttc39aA2ACP1 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ttc39aA2ACP1 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ttc39aA2ACP1 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ttc39aA2ACP1 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ttc39aA2ACP1 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ttc39aA2ACP1 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ttc39aA2ACP1 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ttc39aA2ACP1 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ttc39aA2ACP1 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ttc39aA2ACP1 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ttc39aA2ACP1 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ttc39aA2ACP1 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ttc39aA2ACP1 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ttc39aA2ACP1 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ttc39aA2ACP1 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ttc39aA2ACP1 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ttc39aA2ACP1 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ttc39aA2ACP1 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ttc39aA2ACP1 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ttc39aA2ACP1 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ttc39aA2ACP1 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ttc39aA2ACP1 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ttc39aA2ACP1 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ttc39aA2ACP1 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ttc39aA2ACP1 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ttc39aA2ACP1 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ttc39aA2ACP1 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ttc39aA2ACP1 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ttc39aA2ACP1 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ttc39aA2ACP1 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ttc39aA2ACP1 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ttc39aA2ACP1 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ttc39aA2ACP1 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ttc39aA2ACP1 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ttc39aA2ACP1 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ttc39aA2ACP1 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ttc39aA2ACP1 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ttc39aA2ACP1 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ttc39aA2ACP1 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ttc39aA2ACP1 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ttc39aA2ACP1 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ttc39aA2ACP1 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms