Protein–RNA interactions for Protein: A2A8M8

Pramef6, PRAME family member 6, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef6A2A8M8 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pramef6A2A8M8 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pramef6A2A8M8 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pramef6A2A8M8 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pramef6A2A8M8 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pramef6A2A8M8 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pramef6A2A8M8 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Pramef6A2A8M8 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pramef6A2A8M8 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pramef6A2A8M8 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pramef6A2A8M8 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pramef6A2A8M8 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pramef6A2A8M8 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Pramef6A2A8M8 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pramef6A2A8M8 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pramef6A2A8M8 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pramef6A2A8M8 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Pramef6A2A8M8 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pramef6A2A8M8 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pramef6A2A8M8 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pramef6A2A8M8 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pramef6A2A8M8 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pramef6A2A8M8 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Pramef6A2A8M8 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pramef6A2A8M8 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pramef6A2A8M8 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pramef6A2A8M8 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pramef6A2A8M8 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pramef6A2A8M8 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pramef6A2A8M8 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pramef6A2A8M8 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pramef6A2A8M8 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
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Pramef6A2A8M8 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Pramef6A2A8M8 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pramef6A2A8M8 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pramef6A2A8M8 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pramef6A2A8M8 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Pramef6A2A8M8 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pramef6A2A8M8 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pramef6A2A8M8 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pramef6A2A8M8 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Pramef6A2A8M8 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pramef6A2A8M8 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pramef6A2A8M8 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pramef6A2A8M8 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pramef6A2A8M8 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pramef6A2A8M8 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pramef6A2A8M8 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pramef6A2A8M8 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pramef6A2A8M8 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pramef6A2A8M8 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pramef6A2A8M8 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pramef6A2A8M8 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Pramef6A2A8M8 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pramef6A2A8M8 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Pramef6A2A8M8 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pramef6A2A8M8 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pramef6A2A8M8 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pramef6A2A8M8 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pramef6A2A8M8 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Pramef6A2A8M8 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pramef6A2A8M8 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pramef6A2A8M8 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pramef6A2A8M8 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pramef6A2A8M8 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pramef6A2A8M8 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pramef6A2A8M8 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pramef6A2A8M8 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pramef6A2A8M8 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pramef6A2A8M8 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pramef6A2A8M8 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pramef6A2A8M8 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pramef6A2A8M8 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pramef6A2A8M8 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pramef6A2A8M8 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pramef6A2A8M8 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pramef6A2A8M8 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pramef6A2A8M8 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pramef6A2A8M8 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pramef6A2A8M8 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pramef6A2A8M8 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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