Protein–RNA interactions for Protein: A2A863

Itgb4, Integrin beta-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,818 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb4A2A863 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Itgb4A2A863 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Itgb4A2A863 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Itgb4A2A863 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Itgb4A2A863 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Itgb4A2A863 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Itgb4A2A863 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Itgb4A2A863 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Itgb4A2A863 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Itgb4A2A863 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Itgb4A2A863 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Itgb4A2A863 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Itgb4A2A863 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Itgb4A2A863 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Itgb4A2A863 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Itgb4A2A863 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Itgb4A2A863 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Itgb4A2A863 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Itgb4A2A863 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Itgb4A2A863 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Itgb4A2A863 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Itgb4A2A863 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Itgb4A2A863 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Itgb4A2A863 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Itgb4A2A863 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Itgb4A2A863 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Itgb4A2A863 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Itgb4A2A863 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Itgb4A2A863 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Itgb4A2A863 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Itgb4A2A863 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Itgb4A2A863 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Itgb4A2A863 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Itgb4A2A863 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Itgb4A2A863 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Itgb4A2A863 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Itgb4A2A863 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Itgb4A2A863 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Itgb4A2A863 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Itgb4A2A863 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Itgb4A2A863 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Itgb4A2A863 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Itgb4A2A863 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Itgb4A2A863 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Itgb4A2A863 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Itgb4A2A863 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Itgb4A2A863 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Itgb4A2A863 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Itgb4A2A863 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Itgb4A2A863 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Itgb4A2A863 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Itgb4A2A863 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Itgb4A2A863 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Itgb4A2A863 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Itgb4A2A863 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Itgb4A2A863 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Itgb4A2A863 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Itgb4A2A863 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Itgb4A2A863 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Itgb4A2A863 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Itgb4A2A863 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Itgb4A2A863 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Itgb4A2A863 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Itgb4A2A863 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Itgb4A2A863 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Itgb4A2A863 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Itgb4A2A863 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Itgb4A2A863 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Itgb4A2A863 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Itgb4A2A863 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Itgb4A2A863 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Itgb4A2A863 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Itgb4A2A863 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Itgb4A2A863 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Itgb4A2A863 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Itgb4A2A863 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Itgb4A2A863 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Itgb4A2A863 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Itgb4A2A863 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Itgb4A2A863 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Itgb4A2A863 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Itgb4A2A863 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Itgb4A2A863 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Itgb4A2A863 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Itgb4A2A863 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Itgb4A2A863 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Itgb4A2A863 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Itgb4A2A863 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Itgb4A2A863 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Itgb4A2A863 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Itgb4A2A863 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Itgb4A2A863 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Itgb4A2A863 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Itgb4A2A863 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Itgb4A2A863 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Itgb4A2A863 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Itgb4A2A863 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Itgb4A2A863 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Itgb4A2A863 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Itgb4A2A863 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms