Protein–RNA interactions for Protein: A2A6Q5

Cdc27, Cell division cycle protein 27 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdc27A2A6Q5 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cdc27A2A6Q5 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cdc27A2A6Q5 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cdc27A2A6Q5 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cdc27A2A6Q5 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cdc27A2A6Q5 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Cdc27A2A6Q5 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Cdc27A2A6Q5 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Cdc27A2A6Q5 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Cdc27A2A6Q5 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Cdc27A2A6Q5 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cdc27A2A6Q5 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cdc27A2A6Q5 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cdc27A2A6Q5 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cdc27A2A6Q5 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cdc27A2A6Q5 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cdc27A2A6Q5 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cdc27A2A6Q5 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cdc27A2A6Q5 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cdc27A2A6Q5 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cdc27A2A6Q5 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cdc27A2A6Q5 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cdc27A2A6Q5 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Cdc27A2A6Q5 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cdc27A2A6Q5 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cdc27A2A6Q5 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cdc27A2A6Q5 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cdc27A2A6Q5 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cdc27A2A6Q5 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cdc27A2A6Q5 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cdc27A2A6Q5 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cdc27A2A6Q5 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cdc27A2A6Q5 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cdc27A2A6Q5 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cdc27A2A6Q5 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cdc27A2A6Q5 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cdc27A2A6Q5 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cdc27A2A6Q5 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cdc27A2A6Q5 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cdc27A2A6Q5 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cdc27A2A6Q5 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cdc27A2A6Q5 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cdc27A2A6Q5 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cdc27A2A6Q5 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cdc27A2A6Q5 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cdc27A2A6Q5 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cdc27A2A6Q5 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cdc27A2A6Q5 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cdc27A2A6Q5 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cdc27A2A6Q5 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cdc27A2A6Q5 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cdc27A2A6Q5 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cdc27A2A6Q5 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cdc27A2A6Q5 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cdc27A2A6Q5 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cdc27A2A6Q5 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cdc27A2A6Q5 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cdc27A2A6Q5 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cdc27A2A6Q5 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cdc27A2A6Q5 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cdc27A2A6Q5 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cdc27A2A6Q5 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cdc27A2A6Q5 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Cdc27A2A6Q5 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cdc27A2A6Q5 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cdc27A2A6Q5 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cdc27A2A6Q5 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cdc27A2A6Q5 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cdc27A2A6Q5 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cdc27A2A6Q5 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cdc27A2A6Q5 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cdc27A2A6Q5 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Cdc27A2A6Q5 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cdc27A2A6Q5 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cdc27A2A6Q5 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cdc27A2A6Q5 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cdc27A2A6Q5 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cdc27A2A6Q5 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cdc27A2A6Q5 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cdc27A2A6Q5 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cdc27A2A6Q5 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cdc27A2A6Q5 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cdc27A2A6Q5 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cdc27A2A6Q5 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cdc27A2A6Q5 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cdc27A2A6Q5 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cdc27A2A6Q5 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cdc27A2A6Q5 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cdc27A2A6Q5 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cdc27A2A6Q5 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Cdc27A2A6Q5 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cdc27A2A6Q5 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cdc27A2A6Q5 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cdc27A2A6Q5 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cdc27A2A6Q5 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cdc27A2A6Q5 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cdc27A2A6Q5 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cdc27A2A6Q5 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cdc27A2A6Q5 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cdc27A2A6Q5 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms