Protein–RNA interactions for Protein: A2A5X4

Krtap29-1, Keratin-associated protein 29-1, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krtap29-1A2A5X4 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Krtap29-1A2A5X4 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
Krtap29-1A2A5X4 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
Krtap29-1A2A5X4 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Krtap29-1A2A5X4 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
Krtap29-1A2A5X4 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Krtap29-1A2A5X4 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Krtap29-1A2A5X4 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Krtap29-1A2A5X4 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
Krtap29-1A2A5X4 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Krtap29-1A2A5X4 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Krtap29-1A2A5X4 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Krtap29-1A2A5X4 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Krtap29-1A2A5X4 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Krtap29-1A2A5X4 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Krtap29-1A2A5X4 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Krtap29-1A2A5X4 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Krtap29-1A2A5X4 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.83
Krtap29-1A2A5X4 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Krtap29-1A2A5X4 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Krtap29-1A2A5X4 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Krtap29-1A2A5X4 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Krtap29-1A2A5X4 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Krtap29-1A2A5X4 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Krtap29-1A2A5X4 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Krtap29-1A2A5X4 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Krtap29-1A2A5X4 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Krtap29-1A2A5X4 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Krtap29-1A2A5X4 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Krtap29-1A2A5X4 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Krtap29-1A2A5X4 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Krtap29-1A2A5X4 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Krtap29-1A2A5X4 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Krtap29-1A2A5X4 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Krtap29-1A2A5X4 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Krtap29-1A2A5X4 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Krtap29-1A2A5X4 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Krtap29-1A2A5X4 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Krtap29-1A2A5X4 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Krtap29-1A2A5X4 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Krtap29-1A2A5X4 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Krtap29-1A2A5X4 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Krtap29-1A2A5X4 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Krtap29-1A2A5X4 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Krtap29-1A2A5X4 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Krtap29-1A2A5X4 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Krtap29-1A2A5X4 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Krtap29-1A2A5X4 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Krtap29-1A2A5X4 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Krtap29-1A2A5X4 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Krtap29-1A2A5X4 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Krtap29-1A2A5X4 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Krtap29-1A2A5X4 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Krtap29-1A2A5X4 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Krtap29-1A2A5X4 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Krtap29-1A2A5X4 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Krtap29-1A2A5X4 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Krtap29-1A2A5X4 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Krtap29-1A2A5X4 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Krtap29-1A2A5X4 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Krtap29-1A2A5X4 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Krtap29-1A2A5X4 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Krtap29-1A2A5X4 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Krtap29-1A2A5X4 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Krtap29-1A2A5X4 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Krtap29-1A2A5X4 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Krtap29-1A2A5X4 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Krtap29-1A2A5X4 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Krtap29-1A2A5X4 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Krtap29-1A2A5X4 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Krtap29-1A2A5X4 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Krtap29-1A2A5X4 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Krtap29-1A2A5X4 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Krtap29-1A2A5X4 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Krtap29-1A2A5X4 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Krtap29-1A2A5X4 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Krtap29-1A2A5X4 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Krtap29-1A2A5X4 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Krtap29-1A2A5X4 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Krtap29-1A2A5X4 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Krtap29-1A2A5X4 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Krtap29-1A2A5X4 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Krtap29-1A2A5X4 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Krtap29-1A2A5X4 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Krtap29-1A2A5X4 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Krtap29-1A2A5X4 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Krtap29-1A2A5X4 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Krtap29-1A2A5X4 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Krtap29-1A2A5X4 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Krtap29-1A2A5X4 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Krtap29-1A2A5X4 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Krtap29-1A2A5X4 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Krtap29-1A2A5X4 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Krtap29-1A2A5X4 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Krtap29-1A2A5X4 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Krtap29-1A2A5X4 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Krtap29-1A2A5X4 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Krtap29-1A2A5X4 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Krtap29-1A2A5X4 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Krtap29-1A2A5X4 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms