Protein–RNA interactions for Protein: A0A0N4SWI3

D6Ertd527e, DNA segment, Chr 6, ERATO Doi 527,-expressed, mousemouse

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Length 464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.92
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.92
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.27□□□□□ -0.93
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC9.26□□□□□ -0.93
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.26□□□□□ -0.93
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC9.25□□□□□ -0.93
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC9.25□□□□□ -0.93
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