Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YTW6

Scn2a, Sodium channel protein, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn2aA0A0J9YTW6 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Scn2aA0A0J9YTW6 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Scn2aA0A0J9YTW6 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Scn2aA0A0J9YTW6 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Scn2aA0A0J9YTW6 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Scn2aA0A0J9YTW6 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Scn2aA0A0J9YTW6 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Scn2aA0A0J9YTW6 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Scn2aA0A0J9YTW6 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Scn2aA0A0J9YTW6 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Scn2aA0A0J9YTW6 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Scn2aA0A0J9YTW6 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Scn2aA0A0J9YTW6 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Scn2aA0A0J9YTW6 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Scn2aA0A0J9YTW6 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Scn2aA0A0J9YTW6 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Scn2aA0A0J9YTW6 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Scn2aA0A0J9YTW6 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Scn2aA0A0J9YTW6 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Scn2aA0A0J9YTW6 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Scn2aA0A0J9YTW6 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Scn2aA0A0J9YTW6 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Scn2aA0A0J9YTW6 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Scn2aA0A0J9YTW6 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Scn2aA0A0J9YTW6 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Scn2aA0A0J9YTW6 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Scn2aA0A0J9YTW6 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Scn2aA0A0J9YTW6 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Scn2aA0A0J9YTW6 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Scn2aA0A0J9YTW6 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Scn2aA0A0J9YTW6 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Scn2aA0A0J9YTW6 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Scn2aA0A0J9YTW6 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Scn2aA0A0J9YTW6 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Scn2aA0A0J9YTW6 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Scn2aA0A0J9YTW6 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Scn2aA0A0J9YTW6 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Scn2aA0A0J9YTW6 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Scn2aA0A0J9YTW6 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Scn2aA0A0J9YTW6 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Scn2aA0A0J9YTW6 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Scn2aA0A0J9YTW6 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Scn2aA0A0J9YTW6 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Scn2aA0A0J9YTW6 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Scn2aA0A0J9YTW6 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Scn2aA0A0J9YTW6 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Scn2aA0A0J9YTW6 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Scn2aA0A0J9YTW6 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Scn2aA0A0J9YTW6 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Scn2aA0A0J9YTW6 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Scn2aA0A0J9YTW6 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Scn2aA0A0J9YTW6 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Scn2aA0A0J9YTW6 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Scn2aA0A0J9YTW6 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Scn2aA0A0J9YTW6 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Scn2aA0A0J9YTW6 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Scn2aA0A0J9YTW6 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Scn2aA0A0J9YTW6 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Scn2aA0A0J9YTW6 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Scn2aA0A0J9YTW6 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Scn2aA0A0J9YTW6 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Scn2aA0A0J9YTW6 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Scn2aA0A0J9YTW6 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Scn2aA0A0J9YTW6 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Scn2aA0A0J9YTW6 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Scn2aA0A0J9YTW6 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Scn2aA0A0J9YTW6 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Scn2aA0A0J9YTW6 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Scn2aA0A0J9YTW6 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Scn2aA0A0J9YTW6 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Scn2aA0A0J9YTW6 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Scn2aA0A0J9YTW6 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Scn2aA0A0J9YTW6 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Scn2aA0A0J9YTW6 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Scn2aA0A0J9YTW6 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Scn2aA0A0J9YTW6 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Scn2aA0A0J9YTW6 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Scn2aA0A0J9YTW6 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Scn2aA0A0J9YTW6 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Scn2aA0A0J9YTW6 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Scn2aA0A0J9YTW6 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Scn2aA0A0J9YTW6 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Scn2aA0A0J9YTW6 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Scn2aA0A0J9YTW6 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Scn2aA0A0J9YTW6 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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