Protein–RNA interactions for Protein: S4R181

Ccdc166, Coiled-coil domain-containing 166, mousemouse

Predictions only

Length 449 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc166S4R181 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc166S4R181 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc166S4R181 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc166S4R181 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc166S4R181 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc166S4R181 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc166S4R181 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc166S4R181 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc166S4R181 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc166S4R181 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc166S4R181 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc166S4R181 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc166S4R181 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc166S4R181 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc166S4R181 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc166S4R181 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc166S4R181 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc166S4R181 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc166S4R181 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc166S4R181 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc166S4R181 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc166S4R181 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc166S4R181 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc166S4R181 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Ccdc166S4R181 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc166S4R181 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc166S4R181 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc166S4R181 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc166S4R181 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc166S4R181 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc166S4R181 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc166S4R181 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc166S4R181 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc166S4R181 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc166S4R181 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc166S4R181 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc166S4R181 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc166S4R181 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc166S4R181 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc166S4R181 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc166S4R181 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc166S4R181 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc166S4R181 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc166S4R181 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc166S4R181 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc166S4R181 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc166S4R181 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc166S4R181 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc166S4R181 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc166S4R181 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc166S4R181 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc166S4R181 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc166S4R181 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc166S4R181 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc166S4R181 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc166S4R181 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc166S4R181 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc166S4R181 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ccdc166S4R181 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc166S4R181 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc166S4R181 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc166S4R181 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc166S4R181 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc166S4R181 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc166S4R181 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc166S4R181 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc166S4R181 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc166S4R181 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc166S4R181 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc166S4R181 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc166S4R181 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc166S4R181 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc166S4R181 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc166S4R181 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc166S4R181 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc166S4R181 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc166S4R181 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc166S4R181 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc166S4R181 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc166S4R181 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc166S4R181 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc166S4R181 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc166S4R181 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc166S4R181 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc166S4R181 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc166S4R181 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc166S4R181 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc166S4R181 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc166S4R181 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc166S4R181 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc166S4R181 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc166S4R181 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc166S4R181 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc166S4R181 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc166S4R181 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc166S4R181 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc166S4R181 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc166S4R181 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc166S4R181 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc166S4R181 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.5 ms