Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z131

Sh3bp5, SH3 domain-binding protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp5Q9Z131 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Sh3bp5Q9Z131 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
Sh3bp5Q9Z131 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
Sh3bp5Q9Z131 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Sh3bp5Q9Z131 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Sh3bp5Q9Z131 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Sh3bp5Q9Z131 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Sh3bp5Q9Z131 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Sh3bp5Q9Z131 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Sh3bp5Q9Z131 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Sh3bp5Q9Z131 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Sh3bp5Q9Z131 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Sh3bp5Q9Z131 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Sh3bp5Q9Z131 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Sh3bp5Q9Z131 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Sh3bp5Q9Z131 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Sh3bp5Q9Z131 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Sh3bp5Q9Z131 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Sh3bp5Q9Z131 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Sh3bp5Q9Z131 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
Sh3bp5Q9Z131 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Sh3bp5Q9Z131 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Sh3bp5Q9Z131 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Sh3bp5Q9Z131 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Sh3bp5Q9Z131 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
Sh3bp5Q9Z131 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Sh3bp5Q9Z131 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Sh3bp5Q9Z131 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Sh3bp5Q9Z131 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Sh3bp5Q9Z131 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Sh3bp5Q9Z131 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Sh3bp5Q9Z131 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
Sh3bp5Q9Z131 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Sh3bp5Q9Z131 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Sh3bp5Q9Z131 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Sh3bp5Q9Z131 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Sh3bp5Q9Z131 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Sh3bp5Q9Z131 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Sh3bp5Q9Z131 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.11
Sh3bp5Q9Z131 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
Sh3bp5Q9Z131 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Sh3bp5Q9Z131 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Sh3bp5Q9Z131 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Sh3bp5Q9Z131 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Sh3bp5Q9Z131 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Sh3bp5Q9Z131 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Sh3bp5Q9Z131 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Sh3bp5Q9Z131 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Sh3bp5Q9Z131 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Sh3bp5Q9Z131 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Sh3bp5Q9Z131 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Sh3bp5Q9Z131 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Sh3bp5Q9Z131 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Sh3bp5Q9Z131 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Sh3bp5Q9Z131 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Sh3bp5Q9Z131 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Sh3bp5Q9Z131 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Sh3bp5Q9Z131 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Sh3bp5Q9Z131 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Sh3bp5Q9Z131 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Sh3bp5Q9Z131 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Sh3bp5Q9Z131 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Sh3bp5Q9Z131 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
Sh3bp5Q9Z131 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Sh3bp5Q9Z131 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Sh3bp5Q9Z131 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Sh3bp5Q9Z131 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Sh3bp5Q9Z131 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Sh3bp5Q9Z131 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Sh3bp5Q9Z131 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Sh3bp5Q9Z131 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Sh3bp5Q9Z131 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Sh3bp5Q9Z131 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
Sh3bp5Q9Z131 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Sh3bp5Q9Z131 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Sh3bp5Q9Z131 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Sh3bp5Q9Z131 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Sh3bp5Q9Z131 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Sh3bp5Q9Z131 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Sh3bp5Q9Z131 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Sh3bp5Q9Z131 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Sh3bp5Q9Z131 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Sh3bp5Q9Z131 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Sh3bp5Q9Z131 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Sh3bp5Q9Z131 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Sh3bp5Q9Z131 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Sh3bp5Q9Z131 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Sh3bp5Q9Z131 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Sh3bp5Q9Z131 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Sh3bp5Q9Z131 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Sh3bp5Q9Z131 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Sh3bp5Q9Z131 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Sh3bp5Q9Z131 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Sh3bp5Q9Z131 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Sh3bp5Q9Z131 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Sh3bp5Q9Z131 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Sh3bp5Q9Z131 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Sh3bp5Q9Z131 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Sh3bp5Q9Z131 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Sh3bp5Q9Z131 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
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