Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0Z3

Skp2, S-phase kinase-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skp2Q9Z0Z3 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Skp2Q9Z0Z3 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Skp2Q9Z0Z3 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Skp2Q9Z0Z3 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Skp2Q9Z0Z3 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Skp2Q9Z0Z3 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Skp2Q9Z0Z3 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Skp2Q9Z0Z3 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Skp2Q9Z0Z3 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Skp2Q9Z0Z3 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Skp2Q9Z0Z3 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Skp2Q9Z0Z3 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Skp2Q9Z0Z3 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Skp2Q9Z0Z3 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Skp2Q9Z0Z3 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Skp2Q9Z0Z3 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Skp2Q9Z0Z3 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Skp2Q9Z0Z3 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Skp2Q9Z0Z3 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Skp2Q9Z0Z3 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Skp2Q9Z0Z3 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Skp2Q9Z0Z3 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Skp2Q9Z0Z3 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Skp2Q9Z0Z3 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Skp2Q9Z0Z3 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Skp2Q9Z0Z3 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Skp2Q9Z0Z3 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Skp2Q9Z0Z3 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Skp2Q9Z0Z3 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Skp2Q9Z0Z3 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Skp2Q9Z0Z3 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Skp2Q9Z0Z3 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Skp2Q9Z0Z3 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Skp2Q9Z0Z3 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Skp2Q9Z0Z3 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Skp2Q9Z0Z3 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Skp2Q9Z0Z3 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Skp2Q9Z0Z3 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Skp2Q9Z0Z3 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.91
Skp2Q9Z0Z3 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Skp2Q9Z0Z3 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Skp2Q9Z0Z3 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Skp2Q9Z0Z3 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Skp2Q9Z0Z3 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Skp2Q9Z0Z3 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Skp2Q9Z0Z3 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Skp2Q9Z0Z3 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Skp2Q9Z0Z3 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Skp2Q9Z0Z3 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Skp2Q9Z0Z3 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Skp2Q9Z0Z3 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Skp2Q9Z0Z3 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Skp2Q9Z0Z3 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Skp2Q9Z0Z3 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Skp2Q9Z0Z3 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Skp2Q9Z0Z3 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Skp2Q9Z0Z3 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Skp2Q9Z0Z3 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Skp2Q9Z0Z3 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Skp2Q9Z0Z3 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Skp2Q9Z0Z3 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Skp2Q9Z0Z3 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Skp2Q9Z0Z3 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Skp2Q9Z0Z3 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Skp2Q9Z0Z3 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Skp2Q9Z0Z3 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Skp2Q9Z0Z3 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Skp2Q9Z0Z3 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Skp2Q9Z0Z3 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Skp2Q9Z0Z3 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Skp2Q9Z0Z3 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Skp2Q9Z0Z3 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Skp2Q9Z0Z3 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Skp2Q9Z0Z3 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Skp2Q9Z0Z3 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Skp2Q9Z0Z3 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Skp2Q9Z0Z3 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Skp2Q9Z0Z3 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Skp2Q9Z0Z3 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Skp2Q9Z0Z3 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC20.64■□□□□ 0.9
Skp2Q9Z0Z3 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Skp2Q9Z0Z3 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Skp2Q9Z0Z3 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Skp2Q9Z0Z3 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Skp2Q9Z0Z3 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Skp2Q9Z0Z3 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Skp2Q9Z0Z3 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Skp2Q9Z0Z3 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Skp2Q9Z0Z3 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Skp2Q9Z0Z3 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Skp2Q9Z0Z3 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Skp2Q9Z0Z3 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Skp2Q9Z0Z3 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Skp2Q9Z0Z3 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Skp2Q9Z0Z3 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Skp2Q9Z0Z3 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Skp2Q9Z0Z3 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Skp2Q9Z0Z3 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Skp2Q9Z0Z3 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Skp2Q9Z0Z3 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms