Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0I6

Slfn2, Schlafen 2, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slfn2Q9Z0I6 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Slfn2Q9Z0I6 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Slfn2Q9Z0I6 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Slfn2Q9Z0I6 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Slfn2Q9Z0I6 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Slfn2Q9Z0I6 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Slfn2Q9Z0I6 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Slfn2Q9Z0I6 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Slfn2Q9Z0I6 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Slfn2Q9Z0I6 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Slfn2Q9Z0I6 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Slfn2Q9Z0I6 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Slfn2Q9Z0I6 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Slfn2Q9Z0I6 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Slfn2Q9Z0I6 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Slfn2Q9Z0I6 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Slfn2Q9Z0I6 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Slfn2Q9Z0I6 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Slfn2Q9Z0I6 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Slfn2Q9Z0I6 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Slfn2Q9Z0I6 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Slfn2Q9Z0I6 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Slfn2Q9Z0I6 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Slfn2Q9Z0I6 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Slfn2Q9Z0I6 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Slfn2Q9Z0I6 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Slfn2Q9Z0I6 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Slfn2Q9Z0I6 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Slfn2Q9Z0I6 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Slfn2Q9Z0I6 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Slfn2Q9Z0I6 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Slfn2Q9Z0I6 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Slfn2Q9Z0I6 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Slfn2Q9Z0I6 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Slfn2Q9Z0I6 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Slfn2Q9Z0I6 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Slfn2Q9Z0I6 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Slfn2Q9Z0I6 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Slfn2Q9Z0I6 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Slfn2Q9Z0I6 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Slfn2Q9Z0I6 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Slfn2Q9Z0I6 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Slfn2Q9Z0I6 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Slfn2Q9Z0I6 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Slfn2Q9Z0I6 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Slfn2Q9Z0I6 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Slfn2Q9Z0I6 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Slfn2Q9Z0I6 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Slfn2Q9Z0I6 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Slfn2Q9Z0I6 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Slfn2Q9Z0I6 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Slfn2Q9Z0I6 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Slfn2Q9Z0I6 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Slfn2Q9Z0I6 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Slfn2Q9Z0I6 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Slfn2Q9Z0I6 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Slfn2Q9Z0I6 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Slfn2Q9Z0I6 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Slfn2Q9Z0I6 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Slfn2Q9Z0I6 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Slfn2Q9Z0I6 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Slfn2Q9Z0I6 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Slfn2Q9Z0I6 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Slfn2Q9Z0I6 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Slfn2Q9Z0I6 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Slfn2Q9Z0I6 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Slfn2Q9Z0I6 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Slfn2Q9Z0I6 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Slfn2Q9Z0I6 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Slfn2Q9Z0I6 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Slfn2Q9Z0I6 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Slfn2Q9Z0I6 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Slfn2Q9Z0I6 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Slfn2Q9Z0I6 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Slfn2Q9Z0I6 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Slfn2Q9Z0I6 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Slfn2Q9Z0I6 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Slfn2Q9Z0I6 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Slfn2Q9Z0I6 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Slfn2Q9Z0I6 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Slfn2Q9Z0I6 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Slfn2Q9Z0I6 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Slfn2Q9Z0I6 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Slfn2Q9Z0I6 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Slfn2Q9Z0I6 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Slfn2Q9Z0I6 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Slfn2Q9Z0I6 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Slfn2Q9Z0I6 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Slfn2Q9Z0I6 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Slfn2Q9Z0I6 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Slfn2Q9Z0I6 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Slfn2Q9Z0I6 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Slfn2Q9Z0I6 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Slfn2Q9Z0I6 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Slfn2Q9Z0I6 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Slfn2Q9Z0I6 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Slfn2Q9Z0I6 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Slfn2Q9Z0I6 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Slfn2Q9Z0I6 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Slfn2Q9Z0I6 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms