Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUK7

Opn3, Opsin-3, mousemouse

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn3Q9WUK7 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Opn3Q9WUK7 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Opn3Q9WUK7 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Opn3Q9WUK7 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Opn3Q9WUK7 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Opn3Q9WUK7 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Opn3Q9WUK7 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Opn3Q9WUK7 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Opn3Q9WUK7 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Opn3Q9WUK7 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Opn3Q9WUK7 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Opn3Q9WUK7 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Opn3Q9WUK7 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Opn3Q9WUK7 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Opn3Q9WUK7 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Opn3Q9WUK7 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Opn3Q9WUK7 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Opn3Q9WUK7 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Opn3Q9WUK7 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Opn3Q9WUK7 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Opn3Q9WUK7 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Opn3Q9WUK7 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Opn3Q9WUK7 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Opn3Q9WUK7 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Opn3Q9WUK7 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Opn3Q9WUK7 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Opn3Q9WUK7 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Opn3Q9WUK7 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Opn3Q9WUK7 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Opn3Q9WUK7 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Opn3Q9WUK7 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Opn3Q9WUK7 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Opn3Q9WUK7 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Opn3Q9WUK7 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Opn3Q9WUK7 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Opn3Q9WUK7 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Opn3Q9WUK7 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Opn3Q9WUK7 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Opn3Q9WUK7 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Opn3Q9WUK7 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Opn3Q9WUK7 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Opn3Q9WUK7 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Opn3Q9WUK7 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Opn3Q9WUK7 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Opn3Q9WUK7 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Opn3Q9WUK7 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Opn3Q9WUK7 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Opn3Q9WUK7 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Opn3Q9WUK7 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Opn3Q9WUK7 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Opn3Q9WUK7 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Opn3Q9WUK7 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Opn3Q9WUK7 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Opn3Q9WUK7 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Opn3Q9WUK7 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Opn3Q9WUK7 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Opn3Q9WUK7 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Opn3Q9WUK7 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Opn3Q9WUK7 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Opn3Q9WUK7 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Opn3Q9WUK7 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Opn3Q9WUK7 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Opn3Q9WUK7 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Opn3Q9WUK7 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Opn3Q9WUK7 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Opn3Q9WUK7 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Opn3Q9WUK7 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Opn3Q9WUK7 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Opn3Q9WUK7 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Opn3Q9WUK7 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Opn3Q9WUK7 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Opn3Q9WUK7 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Opn3Q9WUK7 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Opn3Q9WUK7 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Opn3Q9WUK7 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Opn3Q9WUK7 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Opn3Q9WUK7 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Opn3Q9WUK7 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Opn3Q9WUK7 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Opn3Q9WUK7 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Opn3Q9WUK7 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Opn3Q9WUK7 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Opn3Q9WUK7 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Opn3Q9WUK7 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Opn3Q9WUK7 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Opn3Q9WUK7 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Opn3Q9WUK7 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Opn3Q9WUK7 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Opn3Q9WUK7 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Opn3Q9WUK7 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Opn3Q9WUK7 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Opn3Q9WUK7 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Opn3Q9WUK7 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Opn3Q9WUK7 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Opn3Q9WUK7 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Opn3Q9WUK7 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Opn3Q9WUK7 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Opn3Q9WUK7 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Opn3Q9WUK7 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Opn3Q9WUK7 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 253.6 ms