Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU38

Scnn1b, Amiloride-sensitive sodium channel subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scnn1bQ9WU38 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Scnn1bQ9WU38 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Scnn1bQ9WU38 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Scnn1bQ9WU38 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Scnn1bQ9WU38 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Scnn1bQ9WU38 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Scnn1bQ9WU38 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Scnn1bQ9WU38 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Scnn1bQ9WU38 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Scnn1bQ9WU38 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Scnn1bQ9WU38 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Scnn1bQ9WU38 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Scnn1bQ9WU38 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Scnn1bQ9WU38 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Scnn1bQ9WU38 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Scnn1bQ9WU38 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Scnn1bQ9WU38 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Scnn1bQ9WU38 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Scnn1bQ9WU38 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Scnn1bQ9WU38 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Scnn1bQ9WU38 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Scnn1bQ9WU38 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Scnn1bQ9WU38 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Scnn1bQ9WU38 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Scnn1bQ9WU38 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Scnn1bQ9WU38 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Scnn1bQ9WU38 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Scnn1bQ9WU38 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Scnn1bQ9WU38 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Scnn1bQ9WU38 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Scnn1bQ9WU38 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Scnn1bQ9WU38 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Scnn1bQ9WU38 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Scnn1bQ9WU38 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Scnn1bQ9WU38 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Scnn1bQ9WU38 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Scnn1bQ9WU38 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Scnn1bQ9WU38 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Scnn1bQ9WU38 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Scnn1bQ9WU38 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Scnn1bQ9WU38 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Scnn1bQ9WU38 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Scnn1bQ9WU38 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Scnn1bQ9WU38 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Scnn1bQ9WU38 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Scnn1bQ9WU38 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Scnn1bQ9WU38 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Scnn1bQ9WU38 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Scnn1bQ9WU38 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Scnn1bQ9WU38 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Scnn1bQ9WU38 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Scnn1bQ9WU38 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Scnn1bQ9WU38 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Scnn1bQ9WU38 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Scnn1bQ9WU38 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Scnn1bQ9WU38 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Scnn1bQ9WU38 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Scnn1bQ9WU38 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Scnn1bQ9WU38 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Scnn1bQ9WU38 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Scnn1bQ9WU38 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Scnn1bQ9WU38 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Scnn1bQ9WU38 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Scnn1bQ9WU38 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Scnn1bQ9WU38 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Scnn1bQ9WU38 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Scnn1bQ9WU38 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Scnn1bQ9WU38 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Scnn1bQ9WU38 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Scnn1bQ9WU38 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Scnn1bQ9WU38 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Scnn1bQ9WU38 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Scnn1bQ9WU38 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Scnn1bQ9WU38 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Scnn1bQ9WU38 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Scnn1bQ9WU38 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Scnn1bQ9WU38 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Scnn1bQ9WU38 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Scnn1bQ9WU38 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Scnn1bQ9WU38 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Scnn1bQ9WU38 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Scnn1bQ9WU38 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Scnn1bQ9WU38 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Scnn1bQ9WU38 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Scnn1bQ9WU38 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Scnn1bQ9WU38 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Scnn1bQ9WU38 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Scnn1bQ9WU38 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Scnn1bQ9WU38 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Scnn1bQ9WU38 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Scnn1bQ9WU38 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Scnn1bQ9WU38 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Scnn1bQ9WU38 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Scnn1bQ9WU38 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Scnn1bQ9WU38 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Scnn1bQ9WU38 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Scnn1bQ9WU38 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Scnn1bQ9WU38 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Scnn1bQ9WU38 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Scnn1bQ9WU38 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms