Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU22

Ptpn4, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 4, mousemouse

Predictions only

Length 926 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn4Q9WU22 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ptpn4Q9WU22 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ptpn4Q9WU22 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ptpn4Q9WU22 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ptpn4Q9WU22 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ptpn4Q9WU22 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ptpn4Q9WU22 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ptpn4Q9WU22 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ptpn4Q9WU22 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Ptpn4Q9WU22 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ptpn4Q9WU22 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ptpn4Q9WU22 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ptpn4Q9WU22 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ptpn4Q9WU22 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ptpn4Q9WU22 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ptpn4Q9WU22 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ptpn4Q9WU22 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ptpn4Q9WU22 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ptpn4Q9WU22 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ptpn4Q9WU22 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ptpn4Q9WU22 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ptpn4Q9WU22 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ptpn4Q9WU22 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ptpn4Q9WU22 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ptpn4Q9WU22 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ptpn4Q9WU22 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ptpn4Q9WU22 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ptpn4Q9WU22 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ptpn4Q9WU22 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ptpn4Q9WU22 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ptpn4Q9WU22 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ptpn4Q9WU22 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ptpn4Q9WU22 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ptpn4Q9WU22 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ptpn4Q9WU22 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ptpn4Q9WU22 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ptpn4Q9WU22 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ptpn4Q9WU22 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ptpn4Q9WU22 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ptpn4Q9WU22 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ptpn4Q9WU22 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ptpn4Q9WU22 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ptpn4Q9WU22 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ptpn4Q9WU22 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ptpn4Q9WU22 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ptpn4Q9WU22 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ptpn4Q9WU22 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ptpn4Q9WU22 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ptpn4Q9WU22 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ptpn4Q9WU22 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ptpn4Q9WU22 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ptpn4Q9WU22 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ptpn4Q9WU22 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ptpn4Q9WU22 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ptpn4Q9WU22 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ptpn4Q9WU22 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ptpn4Q9WU22 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ptpn4Q9WU22 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ptpn4Q9WU22 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ptpn4Q9WU22 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ptpn4Q9WU22 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ptpn4Q9WU22 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Ptpn4Q9WU22 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ptpn4Q9WU22 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ptpn4Q9WU22 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ptpn4Q9WU22 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ptpn4Q9WU22 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ptpn4Q9WU22 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ptpn4Q9WU22 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ptpn4Q9WU22 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ptpn4Q9WU22 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ptpn4Q9WU22 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Ptpn4Q9WU22 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ptpn4Q9WU22 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ptpn4Q9WU22 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ptpn4Q9WU22 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ptpn4Q9WU22 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ptpn4Q9WU22 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ptpn4Q9WU22 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ptpn4Q9WU22 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ptpn4Q9WU22 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ptpn4Q9WU22 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ptpn4Q9WU22 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ptpn4Q9WU22 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ptpn4Q9WU22 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ptpn4Q9WU22 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ptpn4Q9WU22 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ptpn4Q9WU22 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ptpn4Q9WU22 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ptpn4Q9WU22 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ptpn4Q9WU22 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ptpn4Q9WU22 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ptpn4Q9WU22 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ptpn4Q9WU22 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ptpn4Q9WU22 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Ptpn4Q9WU22 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Ptpn4Q9WU22 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ptpn4Q9WU22 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ptpn4Q9WU22 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ptpn4Q9WU22 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.3 ms