Protein–RNA interactions for Protein: Q9QX98

Ptf1a, Pancreas transcription factor 1 subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 324 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptf1aQ9QX98 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Ptf1aQ9QX98 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Ptf1aQ9QX98 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Ptf1aQ9QX98 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Ptf1aQ9QX98 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Ptf1aQ9QX98 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Ptf1aQ9QX98 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Ptf1aQ9QX98 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Ptf1aQ9QX98 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Ptf1aQ9QX98 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Ptf1aQ9QX98 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Ptf1aQ9QX98 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Ptf1aQ9QX98 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Ptf1aQ9QX98 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Ptf1aQ9QX98 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Ptf1aQ9QX98 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Ptf1aQ9QX98 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Ptf1aQ9QX98 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Ptf1aQ9QX98 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
Ptf1aQ9QX98 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
Ptf1aQ9QX98 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Ptf1aQ9QX98 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Ptf1aQ9QX98 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Ptf1aQ9QX98 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Ptf1aQ9QX98 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Ptf1aQ9QX98 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Ptf1aQ9QX98 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Ptf1aQ9QX98 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
Ptf1aQ9QX98 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Ptf1aQ9QX98 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Ptf1aQ9QX98 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Ptf1aQ9QX98 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Ptf1aQ9QX98 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Ptf1aQ9QX98 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Ptf1aQ9QX98 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Ptf1aQ9QX98 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Ptf1aQ9QX98 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Ptf1aQ9QX98 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
Ptf1aQ9QX98 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Ptf1aQ9QX98 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Ptf1aQ9QX98 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC28.14■■■□□ 2.09
Ptf1aQ9QX98 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Ptf1aQ9QX98 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
Ptf1aQ9QX98 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Ptf1aQ9QX98 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
Ptf1aQ9QX98 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Ptf1aQ9QX98 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Ptf1aQ9QX98 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Ptf1aQ9QX98 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Ptf1aQ9QX98 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Ptf1aQ9QX98 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Ptf1aQ9QX98 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Ptf1aQ9QX98 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Ptf1aQ9QX98 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Ptf1aQ9QX98 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Ptf1aQ9QX98 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Ptf1aQ9QX98 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
Ptf1aQ9QX98 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Ptf1aQ9QX98 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Ptf1aQ9QX98 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Ptf1aQ9QX98 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Ptf1aQ9QX98 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Ptf1aQ9QX98 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Ptf1aQ9QX98 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ptf1aQ9QX98 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ptf1aQ9QX98 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ptf1aQ9QX98 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Ptf1aQ9QX98 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Ptf1aQ9QX98 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Ptf1aQ9QX98 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Ptf1aQ9QX98 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Ptf1aQ9QX98 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ptf1aQ9QX98 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ptf1aQ9QX98 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ptf1aQ9QX98 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ptf1aQ9QX98 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Ptf1aQ9QX98 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ptf1aQ9QX98 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ptf1aQ9QX98 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Ptf1aQ9QX98 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Ptf1aQ9QX98 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
Ptf1aQ9QX98 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Ptf1aQ9QX98 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Ptf1aQ9QX98 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Ptf1aQ9QX98 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Ptf1aQ9QX98 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
Ptf1aQ9QX98 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Ptf1aQ9QX98 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Ptf1aQ9QX98 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Ptf1aQ9QX98 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Ptf1aQ9QX98 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Ptf1aQ9QX98 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Ptf1aQ9QX98 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Ptf1aQ9QX98 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Ptf1aQ9QX98 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Ptf1aQ9QX98 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Ptf1aQ9QX98 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Ptf1aQ9QX98 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Ptf1aQ9QX98 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Ptf1aQ9QX98 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.2 ms