Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHW9

Aldh1a3, Aldehyde dehydrogenase family 1 member A3, mousemouse

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aldh1a3Q9JHW9 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Aldh1a3Q9JHW9 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Aldh1a3Q9JHW9 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Aldh1a3Q9JHW9 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Aldh1a3Q9JHW9 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Aldh1a3Q9JHW9 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Aldh1a3Q9JHW9 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Aldh1a3Q9JHW9 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Aldh1a3Q9JHW9 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Aldh1a3Q9JHW9 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Aldh1a3Q9JHW9 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Aldh1a3Q9JHW9 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Aldh1a3Q9JHW9 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Aldh1a3Q9JHW9 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Aldh1a3Q9JHW9 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Aldh1a3Q9JHW9 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Aldh1a3Q9JHW9 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Aldh1a3Q9JHW9 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Aldh1a3Q9JHW9 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Aldh1a3Q9JHW9 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Aldh1a3Q9JHW9 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Aldh1a3Q9JHW9 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Aldh1a3Q9JHW9 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Aldh1a3Q9JHW9 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Aldh1a3Q9JHW9 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Aldh1a3Q9JHW9 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Aldh1a3Q9JHW9 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Aldh1a3Q9JHW9 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Aldh1a3Q9JHW9 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Aldh1a3Q9JHW9 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Aldh1a3Q9JHW9 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Aldh1a3Q9JHW9 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Aldh1a3Q9JHW9 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Aldh1a3Q9JHW9 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Aldh1a3Q9JHW9 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Aldh1a3Q9JHW9 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Aldh1a3Q9JHW9 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Aldh1a3Q9JHW9 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Aldh1a3Q9JHW9 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Aldh1a3Q9JHW9 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Aldh1a3Q9JHW9 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Aldh1a3Q9JHW9 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Aldh1a3Q9JHW9 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Aldh1a3Q9JHW9 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Aldh1a3Q9JHW9 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Aldh1a3Q9JHW9 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Aldh1a3Q9JHW9 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Aldh1a3Q9JHW9 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Aldh1a3Q9JHW9 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Aldh1a3Q9JHW9 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Aldh1a3Q9JHW9 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Aldh1a3Q9JHW9 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Aldh1a3Q9JHW9 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Aldh1a3Q9JHW9 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Aldh1a3Q9JHW9 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Aldh1a3Q9JHW9 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Aldh1a3Q9JHW9 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Aldh1a3Q9JHW9 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Aldh1a3Q9JHW9 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Aldh1a3Q9JHW9 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Aldh1a3Q9JHW9 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Aldh1a3Q9JHW9 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Aldh1a3Q9JHW9 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Aldh1a3Q9JHW9 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Aldh1a3Q9JHW9 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Aldh1a3Q9JHW9 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Aldh1a3Q9JHW9 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Aldh1a3Q9JHW9 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Aldh1a3Q9JHW9 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Aldh1a3Q9JHW9 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Aldh1a3Q9JHW9 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Aldh1a3Q9JHW9 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Aldh1a3Q9JHW9 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Aldh1a3Q9JHW9 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Aldh1a3Q9JHW9 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Aldh1a3Q9JHW9 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Aldh1a3Q9JHW9 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Aldh1a3Q9JHW9 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Aldh1a3Q9JHW9 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Aldh1a3Q9JHW9 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Aldh1a3Q9JHW9 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Aldh1a3Q9JHW9 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Aldh1a3Q9JHW9 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Aldh1a3Q9JHW9 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Aldh1a3Q9JHW9 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Aldh1a3Q9JHW9 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Aldh1a3Q9JHW9 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Aldh1a3Q9JHW9 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Aldh1a3Q9JHW9 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Aldh1a3Q9JHW9 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Aldh1a3Q9JHW9 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Aldh1a3Q9JHW9 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Aldh1a3Q9JHW9 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Aldh1a3Q9JHW9 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Aldh1a3Q9JHW9 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Aldh1a3Q9JHW9 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Aldh1a3Q9JHW9 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Aldh1a3Q9JHW9 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Aldh1a3Q9JHW9 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Aldh1a3Q9JHW9 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.2 ms