Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ80

Nif3l1, NIF3-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nif3l1Q9EQ80 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nif3l1Q9EQ80 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nif3l1Q9EQ80 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Nif3l1Q9EQ80 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Nif3l1Q9EQ80 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nif3l1Q9EQ80 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nif3l1Q9EQ80 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nif3l1Q9EQ80 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nif3l1Q9EQ80 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nif3l1Q9EQ80 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nif3l1Q9EQ80 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nif3l1Q9EQ80 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nif3l1Q9EQ80 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Nif3l1Q9EQ80 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nif3l1Q9EQ80 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nif3l1Q9EQ80 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nif3l1Q9EQ80 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nif3l1Q9EQ80 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nif3l1Q9EQ80 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nif3l1Q9EQ80 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nif3l1Q9EQ80 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nif3l1Q9EQ80 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nif3l1Q9EQ80 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nif3l1Q9EQ80 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nif3l1Q9EQ80 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nif3l1Q9EQ80 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nif3l1Q9EQ80 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nif3l1Q9EQ80 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nif3l1Q9EQ80 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nif3l1Q9EQ80 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nif3l1Q9EQ80 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nif3l1Q9EQ80 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nif3l1Q9EQ80 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nif3l1Q9EQ80 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Nif3l1Q9EQ80 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nif3l1Q9EQ80 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nif3l1Q9EQ80 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nif3l1Q9EQ80 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nif3l1Q9EQ80 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nif3l1Q9EQ80 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nif3l1Q9EQ80 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nif3l1Q9EQ80 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nif3l1Q9EQ80 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nif3l1Q9EQ80 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nif3l1Q9EQ80 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nif3l1Q9EQ80 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nif3l1Q9EQ80 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nif3l1Q9EQ80 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nif3l1Q9EQ80 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nif3l1Q9EQ80 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Nif3l1Q9EQ80 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Nif3l1Q9EQ80 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nif3l1Q9EQ80 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nif3l1Q9EQ80 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nif3l1Q9EQ80 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Nif3l1Q9EQ80 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nif3l1Q9EQ80 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nif3l1Q9EQ80 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nif3l1Q9EQ80 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nif3l1Q9EQ80 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nif3l1Q9EQ80 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nif3l1Q9EQ80 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nif3l1Q9EQ80 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nif3l1Q9EQ80 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nif3l1Q9EQ80 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nif3l1Q9EQ80 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nif3l1Q9EQ80 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nif3l1Q9EQ80 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nif3l1Q9EQ80 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nif3l1Q9EQ80 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nif3l1Q9EQ80 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nif3l1Q9EQ80 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nif3l1Q9EQ80 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nif3l1Q9EQ80 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nif3l1Q9EQ80 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nif3l1Q9EQ80 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nif3l1Q9EQ80 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nif3l1Q9EQ80 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nif3l1Q9EQ80 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Nif3l1Q9EQ80 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nif3l1Q9EQ80 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nif3l1Q9EQ80 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nif3l1Q9EQ80 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nif3l1Q9EQ80 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nif3l1Q9EQ80 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nif3l1Q9EQ80 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nif3l1Q9EQ80 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nif3l1Q9EQ80 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nif3l1Q9EQ80 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nif3l1Q9EQ80 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Nif3l1Q9EQ80 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Nif3l1Q9EQ80 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Nif3l1Q9EQ80 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nif3l1Q9EQ80 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nif3l1Q9EQ80 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nif3l1Q9EQ80 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nif3l1Q9EQ80 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nif3l1Q9EQ80 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nif3l1Q9EQ80 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Nif3l1Q9EQ80 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms