Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ00

Ropn1l, Ropporin-1-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ropn1lQ9EQ00 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ropn1lQ9EQ00 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ropn1lQ9EQ00 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ropn1lQ9EQ00 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ropn1lQ9EQ00 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Ropn1lQ9EQ00 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ropn1lQ9EQ00 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ropn1lQ9EQ00 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ropn1lQ9EQ00 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ropn1lQ9EQ00 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ropn1lQ9EQ00 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ropn1lQ9EQ00 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Ropn1lQ9EQ00 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ropn1lQ9EQ00 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ropn1lQ9EQ00 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ropn1lQ9EQ00 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Ropn1lQ9EQ00 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ropn1lQ9EQ00 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Ropn1lQ9EQ00 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Ropn1lQ9EQ00 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ropn1lQ9EQ00 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ropn1lQ9EQ00 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ropn1lQ9EQ00 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ropn1lQ9EQ00 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ropn1lQ9EQ00 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ropn1lQ9EQ00 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ropn1lQ9EQ00 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ropn1lQ9EQ00 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ropn1lQ9EQ00 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ropn1lQ9EQ00 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ropn1lQ9EQ00 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ropn1lQ9EQ00 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ropn1lQ9EQ00 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ropn1lQ9EQ00 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ropn1lQ9EQ00 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ropn1lQ9EQ00 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ropn1lQ9EQ00 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ropn1lQ9EQ00 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ropn1lQ9EQ00 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ropn1lQ9EQ00 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ropn1lQ9EQ00 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Ropn1lQ9EQ00 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ropn1lQ9EQ00 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ropn1lQ9EQ00 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ropn1lQ9EQ00 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ropn1lQ9EQ00 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ropn1lQ9EQ00 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ropn1lQ9EQ00 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ropn1lQ9EQ00 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ropn1lQ9EQ00 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ropn1lQ9EQ00 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ropn1lQ9EQ00 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ropn1lQ9EQ00 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ropn1lQ9EQ00 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ropn1lQ9EQ00 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ropn1lQ9EQ00 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ropn1lQ9EQ00 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ropn1lQ9EQ00 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ropn1lQ9EQ00 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ropn1lQ9EQ00 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ropn1lQ9EQ00 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ropn1lQ9EQ00 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ropn1lQ9EQ00 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ropn1lQ9EQ00 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ropn1lQ9EQ00 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ropn1lQ9EQ00 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ropn1lQ9EQ00 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ropn1lQ9EQ00 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ropn1lQ9EQ00 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Ropn1lQ9EQ00 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ropn1lQ9EQ00 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ropn1lQ9EQ00 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ropn1lQ9EQ00 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ropn1lQ9EQ00 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ropn1lQ9EQ00 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ropn1lQ9EQ00 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ropn1lQ9EQ00 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ropn1lQ9EQ00 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ropn1lQ9EQ00 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ropn1lQ9EQ00 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ropn1lQ9EQ00 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ropn1lQ9EQ00 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ropn1lQ9EQ00 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ropn1lQ9EQ00 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ropn1lQ9EQ00 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ropn1lQ9EQ00 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ropn1lQ9EQ00 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ropn1lQ9EQ00 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ropn1lQ9EQ00 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ropn1lQ9EQ00 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ropn1lQ9EQ00 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ropn1lQ9EQ00 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ropn1lQ9EQ00 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ropn1lQ9EQ00 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ropn1lQ9EQ00 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ropn1lQ9EQ00 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ropn1lQ9EQ00 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ropn1lQ9EQ00 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Ropn1lQ9EQ00 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ropn1lQ9EQ00 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms