Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA39

Tmbim4, Protein lifeguard 4, mousemouse

Predictions only

Length 238 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmbim4Q9DA39 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tmbim4Q9DA39 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tmbim4Q9DA39 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tmbim4Q9DA39 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tmbim4Q9DA39 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tmbim4Q9DA39 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tmbim4Q9DA39 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tmbim4Q9DA39 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tmbim4Q9DA39 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tmbim4Q9DA39 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tmbim4Q9DA39 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tmbim4Q9DA39 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tmbim4Q9DA39 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tmbim4Q9DA39 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tmbim4Q9DA39 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Tmbim4Q9DA39 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tmbim4Q9DA39 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tmbim4Q9DA39 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tmbim4Q9DA39 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tmbim4Q9DA39 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tmbim4Q9DA39 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tmbim4Q9DA39 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tmbim4Q9DA39 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tmbim4Q9DA39 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tmbim4Q9DA39 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tmbim4Q9DA39 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tmbim4Q9DA39 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tmbim4Q9DA39 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tmbim4Q9DA39 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tmbim4Q9DA39 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tmbim4Q9DA39 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Tmbim4Q9DA39 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tmbim4Q9DA39 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tmbim4Q9DA39 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tmbim4Q9DA39 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tmbim4Q9DA39 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Tmbim4Q9DA39 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tmbim4Q9DA39 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tmbim4Q9DA39 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tmbim4Q9DA39 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tmbim4Q9DA39 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tmbim4Q9DA39 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tmbim4Q9DA39 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tmbim4Q9DA39 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tmbim4Q9DA39 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tmbim4Q9DA39 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tmbim4Q9DA39 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tmbim4Q9DA39 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Tmbim4Q9DA39 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tmbim4Q9DA39 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tmbim4Q9DA39 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tmbim4Q9DA39 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tmbim4Q9DA39 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tmbim4Q9DA39 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tmbim4Q9DA39 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tmbim4Q9DA39 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tmbim4Q9DA39 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tmbim4Q9DA39 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tmbim4Q9DA39 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tmbim4Q9DA39 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tmbim4Q9DA39 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tmbim4Q9DA39 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tmbim4Q9DA39 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Tmbim4Q9DA39 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Tmbim4Q9DA39 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tmbim4Q9DA39 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tmbim4Q9DA39 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tmbim4Q9DA39 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tmbim4Q9DA39 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tmbim4Q9DA39 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tmbim4Q9DA39 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tmbim4Q9DA39 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tmbim4Q9DA39 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tmbim4Q9DA39 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tmbim4Q9DA39 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tmbim4Q9DA39 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tmbim4Q9DA39 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tmbim4Q9DA39 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tmbim4Q9DA39 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tmbim4Q9DA39 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tmbim4Q9DA39 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tmbim4Q9DA39 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tmbim4Q9DA39 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tmbim4Q9DA39 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tmbim4Q9DA39 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Tmbim4Q9DA39 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tmbim4Q9DA39 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tmbim4Q9DA39 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tmbim4Q9DA39 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tmbim4Q9DA39 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tmbim4Q9DA39 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tmbim4Q9DA39 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tmbim4Q9DA39 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tmbim4Q9DA39 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tmbim4Q9DA39 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tmbim4Q9DA39 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tmbim4Q9DA39 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tmbim4Q9DA39 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tmbim4Q9DA39 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tmbim4Q9DA39 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms