Protein–RNA interactions for Protein: Q9D906

Atg7, Ubiquitin-like modifier-activating enzyme ATG7, mousemouse

Predictions only

Length 698 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg7Q9D906 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Atg7Q9D906 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Atg7Q9D906 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Atg7Q9D906 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Atg7Q9D906 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Atg7Q9D906 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Atg7Q9D906 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Atg7Q9D906 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Atg7Q9D906 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Atg7Q9D906 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Atg7Q9D906 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Atg7Q9D906 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Atg7Q9D906 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Atg7Q9D906 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Atg7Q9D906 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Atg7Q9D906 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Atg7Q9D906 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Atg7Q9D906 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Atg7Q9D906 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Atg7Q9D906 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Atg7Q9D906 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Atg7Q9D906 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Atg7Q9D906 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Atg7Q9D906 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Atg7Q9D906 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Atg7Q9D906 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Atg7Q9D906 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Atg7Q9D906 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Atg7Q9D906 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Atg7Q9D906 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Atg7Q9D906 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Atg7Q9D906 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Atg7Q9D906 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Atg7Q9D906 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Atg7Q9D906 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Atg7Q9D906 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Atg7Q9D906 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Atg7Q9D906 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Atg7Q9D906 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Atg7Q9D906 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Atg7Q9D906 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Atg7Q9D906 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Atg7Q9D906 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Atg7Q9D906 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Atg7Q9D906 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Atg7Q9D906 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Atg7Q9D906 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Atg7Q9D906 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Atg7Q9D906 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Atg7Q9D906 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Atg7Q9D906 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Atg7Q9D906 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Atg7Q9D906 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Atg7Q9D906 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Atg7Q9D906 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Atg7Q9D906 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Atg7Q9D906 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Atg7Q9D906 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Atg7Q9D906 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Atg7Q9D906 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Atg7Q9D906 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Atg7Q9D906 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Atg7Q9D906 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Atg7Q9D906 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Atg7Q9D906 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Atg7Q9D906 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Atg7Q9D906 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Atg7Q9D906 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Atg7Q9D906 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Atg7Q9D906 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Atg7Q9D906 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Atg7Q9D906 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Atg7Q9D906 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Atg7Q9D906 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Atg7Q9D906 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Atg7Q9D906 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Atg7Q9D906 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Atg7Q9D906 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Atg7Q9D906 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Atg7Q9D906 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Atg7Q9D906 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Atg7Q9D906 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Atg7Q9D906 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Atg7Q9D906 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Atg7Q9D906 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Atg7Q9D906 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Atg7Q9D906 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Atg7Q9D906 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Atg7Q9D906 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Atg7Q9D906 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Atg7Q9D906 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Atg7Q9D906 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Atg7Q9D906 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Atg7Q9D906 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Atg7Q9D906 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Atg7Q9D906 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Atg7Q9D906 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Atg7Q9D906 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Atg7Q9D906 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Atg7Q9D906 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms