Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXL1

Tmem50a, Transmembrane protein 50A, mousemouse

Predictions only

Length 157 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem50aQ9CXL1 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tmem50aQ9CXL1 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tmem50aQ9CXL1 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tmem50aQ9CXL1 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tmem50aQ9CXL1 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tmem50aQ9CXL1 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tmem50aQ9CXL1 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tmem50aQ9CXL1 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tmem50aQ9CXL1 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tmem50aQ9CXL1 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tmem50aQ9CXL1 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tmem50aQ9CXL1 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tmem50aQ9CXL1 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tmem50aQ9CXL1 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tmem50aQ9CXL1 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tmem50aQ9CXL1 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tmem50aQ9CXL1 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tmem50aQ9CXL1 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tmem50aQ9CXL1 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Tmem50aQ9CXL1 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Tmem50aQ9CXL1 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Tmem50aQ9CXL1 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
Tmem50aQ9CXL1 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tmem50aQ9CXL1 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tmem50aQ9CXL1 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tmem50aQ9CXL1 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tmem50aQ9CXL1 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tmem50aQ9CXL1 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tmem50aQ9CXL1 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tmem50aQ9CXL1 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tmem50aQ9CXL1 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tmem50aQ9CXL1 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tmem50aQ9CXL1 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tmem50aQ9CXL1 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tmem50aQ9CXL1 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tmem50aQ9CXL1 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tmem50aQ9CXL1 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tmem50aQ9CXL1 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tmem50aQ9CXL1 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tmem50aQ9CXL1 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tmem50aQ9CXL1 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tmem50aQ9CXL1 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tmem50aQ9CXL1 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Tmem50aQ9CXL1 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tmem50aQ9CXL1 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tmem50aQ9CXL1 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tmem50aQ9CXL1 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tmem50aQ9CXL1 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tmem50aQ9CXL1 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tmem50aQ9CXL1 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tmem50aQ9CXL1 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tmem50aQ9CXL1 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tmem50aQ9CXL1 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tmem50aQ9CXL1 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Tmem50aQ9CXL1 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tmem50aQ9CXL1 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tmem50aQ9CXL1 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tmem50aQ9CXL1 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tmem50aQ9CXL1 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tmem50aQ9CXL1 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tmem50aQ9CXL1 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tmem50aQ9CXL1 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tmem50aQ9CXL1 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tmem50aQ9CXL1 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tmem50aQ9CXL1 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmem50aQ9CXL1 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tmem50aQ9CXL1 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Tmem50aQ9CXL1 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Tmem50aQ9CXL1 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tmem50aQ9CXL1 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Tmem50aQ9CXL1 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tmem50aQ9CXL1 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tmem50aQ9CXL1 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tmem50aQ9CXL1 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tmem50aQ9CXL1 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tmem50aQ9CXL1 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tmem50aQ9CXL1 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tmem50aQ9CXL1 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Tmem50aQ9CXL1 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tmem50aQ9CXL1 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tmem50aQ9CXL1 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tmem50aQ9CXL1 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tmem50aQ9CXL1 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tmem50aQ9CXL1 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tmem50aQ9CXL1 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tmem50aQ9CXL1 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tmem50aQ9CXL1 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tmem50aQ9CXL1 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tmem50aQ9CXL1 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tmem50aQ9CXL1 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tmem50aQ9CXL1 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tmem50aQ9CXL1 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Tmem50aQ9CXL1 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tmem50aQ9CXL1 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tmem50aQ9CXL1 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tmem50aQ9CXL1 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tmem50aQ9CXL1 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmem50aQ9CXL1 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmem50aQ9CXL1 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmem50aQ9CXL1 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.4 ms