Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX92

Gje1, Gap junction epsilon-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gje1Q9CX92 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gje1Q9CX92 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Gje1Q9CX92 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Gje1Q9CX92 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gje1Q9CX92 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gje1Q9CX92 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gje1Q9CX92 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gje1Q9CX92 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Gje1Q9CX92 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Gje1Q9CX92 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gje1Q9CX92 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Gje1Q9CX92 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Gje1Q9CX92 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gje1Q9CX92 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Gje1Q9CX92 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gje1Q9CX92 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Gje1Q9CX92 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gje1Q9CX92 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gje1Q9CX92 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gje1Q9CX92 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gje1Q9CX92 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gje1Q9CX92 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gje1Q9CX92 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gje1Q9CX92 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Gje1Q9CX92 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gje1Q9CX92 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gje1Q9CX92 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gje1Q9CX92 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gje1Q9CX92 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gje1Q9CX92 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Gje1Q9CX92 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gje1Q9CX92 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gje1Q9CX92 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gje1Q9CX92 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Gje1Q9CX92 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gje1Q9CX92 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gje1Q9CX92 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gje1Q9CX92 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gje1Q9CX92 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gje1Q9CX92 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gje1Q9CX92 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gje1Q9CX92 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gje1Q9CX92 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gje1Q9CX92 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gje1Q9CX92 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Gje1Q9CX92 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gje1Q9CX92 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gje1Q9CX92 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gje1Q9CX92 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gje1Q9CX92 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gje1Q9CX92 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gje1Q9CX92 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gje1Q9CX92 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gje1Q9CX92 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gje1Q9CX92 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gje1Q9CX92 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gje1Q9CX92 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gje1Q9CX92 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Gje1Q9CX92 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gje1Q9CX92 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gje1Q9CX92 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gje1Q9CX92 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
Gje1Q9CX92 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gje1Q9CX92 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gje1Q9CX92 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gje1Q9CX92 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gje1Q9CX92 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gje1Q9CX92 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gje1Q9CX92 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gje1Q9CX92 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gje1Q9CX92 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gje1Q9CX92 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gje1Q9CX92 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gje1Q9CX92 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gje1Q9CX92 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gje1Q9CX92 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gje1Q9CX92 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gje1Q9CX92 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gje1Q9CX92 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gje1Q9CX92 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gje1Q9CX92 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gje1Q9CX92 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gje1Q9CX92 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gje1Q9CX92 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gje1Q9CX92 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gje1Q9CX92 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gje1Q9CX92 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gje1Q9CX92 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gje1Q9CX92 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gje1Q9CX92 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gje1Q9CX92 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gje1Q9CX92 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gje1Q9CX92 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gje1Q9CX92 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gje1Q9CX92 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gje1Q9CX92 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gje1Q9CX92 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gje1Q9CX92 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gje1Q9CX92 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gje1Q9CX92 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms