Protein–RNA interactions for Protein: Q9CV82

2310003L06Rik, RIKEN cDNA 2310003L06 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2310003L06RikQ9CV82 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
2310003L06RikQ9CV82 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
2310003L06RikQ9CV82 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
2310003L06RikQ9CV82 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
2310003L06RikQ9CV82 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
2310003L06RikQ9CV82 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
2310003L06RikQ9CV82 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
2310003L06RikQ9CV82 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
2310003L06RikQ9CV82 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
2310003L06RikQ9CV82 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
2310003L06RikQ9CV82 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
2310003L06RikQ9CV82 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
2310003L06RikQ9CV82 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
2310003L06RikQ9CV82 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
2310003L06RikQ9CV82 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
2310003L06RikQ9CV82 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
2310003L06RikQ9CV82 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
2310003L06RikQ9CV82 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
2310003L06RikQ9CV82 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
2310003L06RikQ9CV82 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
2310003L06RikQ9CV82 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
2310003L06RikQ9CV82 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
2310003L06RikQ9CV82 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
2310003L06RikQ9CV82 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
2310003L06RikQ9CV82 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
2310003L06RikQ9CV82 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
2310003L06RikQ9CV82 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
2310003L06RikQ9CV82 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
2310003L06RikQ9CV82 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
2310003L06RikQ9CV82 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
2310003L06RikQ9CV82 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
2310003L06RikQ9CV82 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
2310003L06RikQ9CV82 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
2310003L06RikQ9CV82 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
2310003L06RikQ9CV82 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
2310003L06RikQ9CV82 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
2310003L06RikQ9CV82 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
2310003L06RikQ9CV82 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
2310003L06RikQ9CV82 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
2310003L06RikQ9CV82 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
2310003L06RikQ9CV82 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
2310003L06RikQ9CV82 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
2310003L06RikQ9CV82 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
2310003L06RikQ9CV82 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
2310003L06RikQ9CV82 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
2310003L06RikQ9CV82 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
2310003L06RikQ9CV82 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
2310003L06RikQ9CV82 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
2310003L06RikQ9CV82 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
2310003L06RikQ9CV82 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
2310003L06RikQ9CV82 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
2310003L06RikQ9CV82 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
2310003L06RikQ9CV82 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
2310003L06RikQ9CV82 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
2310003L06RikQ9CV82 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
2310003L06RikQ9CV82 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
2310003L06RikQ9CV82 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
2310003L06RikQ9CV82 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
2310003L06RikQ9CV82 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
2310003L06RikQ9CV82 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
2310003L06RikQ9CV82 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
2310003L06RikQ9CV82 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
2310003L06RikQ9CV82 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
2310003L06RikQ9CV82 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
2310003L06RikQ9CV82 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
2310003L06RikQ9CV82 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
2310003L06RikQ9CV82 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
2310003L06RikQ9CV82 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
2310003L06RikQ9CV82 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
2310003L06RikQ9CV82 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
2310003L06RikQ9CV82 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
2310003L06RikQ9CV82 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
2310003L06RikQ9CV82 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
2310003L06RikQ9CV82 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
2310003L06RikQ9CV82 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
2310003L06RikQ9CV82 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
2310003L06RikQ9CV82 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
2310003L06RikQ9CV82 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
2310003L06RikQ9CV82 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
2310003L06RikQ9CV82 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
2310003L06RikQ9CV82 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
2310003L06RikQ9CV82 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
2310003L06RikQ9CV82 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
2310003L06RikQ9CV82 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
2310003L06RikQ9CV82 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
2310003L06RikQ9CV82 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
2310003L06RikQ9CV82 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
2310003L06RikQ9CV82 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
2310003L06RikQ9CV82 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
2310003L06RikQ9CV82 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
2310003L06RikQ9CV82 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
2310003L06RikQ9CV82 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
2310003L06RikQ9CV82 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
2310003L06RikQ9CV82 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
2310003L06RikQ9CV82 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
2310003L06RikQ9CV82 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
2310003L06RikQ9CV82 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
2310003L06RikQ9CV82 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
2310003L06RikQ9CV82 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
2310003L06RikQ9CV82 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms